53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0554 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1890    100 
 
 
1372 bp  2720    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0930146  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  100 
 
 
591 bp  1172    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0921  putative methylamine utilization protein  100 
 
 
663 bp  1314    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  87.27 
 
 
1377 bp  1124    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  89.18 
 
 
1311 bp  1304    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  89.01 
 
 
1386 bp  1289    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  86.84 
 
 
1347 bp  1066    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  89.01 
 
 
1386 bp  1289    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  86.75 
 
 
1347 bp  1072    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  83.21 
 
 
1632 bp  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  88.68 
 
 
1398 bp  1257    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  99.37 
 
 
1425 bp  2748    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  99.42 
 
 
1371 bp  2648    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0554    100 
 
 
1426 bp  2827    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000269729  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  83.54 
 
 
1623 bp  636  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  83.54 
 
 
1623 bp  636  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  83.54 
 
 
1623 bp  636  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  83.44 
 
 
1623 bp  628  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  83.44 
 
 
1623 bp  628  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  83.44 
 
 
1623 bp  628  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  83.44 
 
 
1623 bp  628  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  80.62 
 
 
1302 bp  365  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  80.89 
 
 
1350 bp  147  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  79.27 
 
 
1341 bp  117  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  78.98 
 
 
1341 bp  105  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  96.15 
 
 
1350 bp  87.7  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  96.15 
 
 
1350 bp  87.7  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  94.23 
 
 
1386 bp  79.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  94.23 
 
 
1308 bp  79.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  94.23 
 
 
1410 bp  79.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  93.75 
 
 
1350 bp  71.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0551  hypothetical protein  100 
 
 
117 bp  63.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  90.2 
 
 
1386 bp  61.9  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  88.46 
 
 
1611 bp  56  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  87.5 
 
 
1389 bp  56  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  88.46 
 
 
1611 bp  56  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  88.46 
 
 
1623 bp  56  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  88.46 
 
 
1611 bp  56  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  88.46 
 
 
1611 bp  56  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  96.77 
 
 
1092 bp  54  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 
1284 bp  54  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  96.67 
 
 
1419 bp  52  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  96.67 
 
 
1350 bp  52  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  100 
 
 
1419 bp  50.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  85.71 
 
 
1416 bp  48.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  85.71 
 
 
1416 bp  48.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  84.38 
 
 
1407 bp  48.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  85.71 
 
 
1416 bp  48.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  85.71 
 
 
1416 bp  48.1  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  93.75 
 
 
1233 bp  48.1  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  86.54 
 
 
1578 bp  48.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  85.71 
 
 
1404 bp  48.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  85.71 
 
 
1125 bp  48.1  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>