31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0055 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0055    100 
 
 
1191 bp  2361    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0068    100 
 
 
567 bp  1124    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0067    100 
 
 
564 bp  1118    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  99.5 
 
 
1191 bp  2313    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  99.66 
 
 
1191 bp  2329    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  100 
 
 
567 bp  1124    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  100 
 
 
564 bp  1118    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  100 
 
 
567 bp  1124    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  100 
 
 
564 bp  1118    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  99.5 
 
 
1191 bp  2313    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  94.7 
 
 
1191 bp  1826    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  87.94 
 
 
1179 bp  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  87.77 
 
 
1179 bp  521  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  86.17 
 
 
1173 bp  317  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  86.17 
 
 
1173 bp  317  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  86.17 
 
 
1173 bp  317  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  83.04 
 
 
1185 bp  256  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  82.99 
 
 
1206 bp  250  8e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  85.77 
 
 
1173 bp  210  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  83.99 
 
 
1173 bp  200  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  84.96 
 
 
1173 bp  194  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  86.22 
 
 
1206 bp  174  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  86.61 
 
 
1194 bp  117  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  81.82 
 
 
1206 bp  101  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  86.75 
 
 
1203 bp  77.8  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  81.08 
 
 
1149 bp  54  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5216  ABC transporter related  100 
 
 
1176 bp  50.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329969 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4931  ABC transporter related  100 
 
 
1179 bp  50.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247063  normal  0.893842 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3393  ABC transporter related  100 
 
 
1176 bp  50.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.671185  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4687  ABC transporter related  100 
 
 
1176 bp  50.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00669309  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0033  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
579 bp  48.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519316  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>