105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA2088 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0443    100 
 
 
1023 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0470  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1512  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1863  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2088    100 
 
 
303 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2090  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2639  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3241  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1213  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0180  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.017513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1099  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2011  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2588    100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2619  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
2292 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3176  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0456  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321597  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1226  transposase,/IS1001/IS1096/IS1165  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576272  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0991  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1917  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00988303  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2187  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2654  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3299  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1119  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2202  isrso15-transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0156  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1283  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.166127  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1958  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3446  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3471  ISBma1, transposase  100 
 
 
1221 bp  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77379  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0133  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0319    99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1016  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1233  ISBma1, transposase, interruption-C  99.67 
 
 
498 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1934  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390683  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2438  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3181  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1123  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2072  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1783  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2342  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3784  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.109765  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1460  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
576 bp  593  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0465  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0916  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1161 bp  593  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2078  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1161 bp  593  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.64027  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3162  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1161 bp  593  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1101  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0150  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.116574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0351  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0614  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
480 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0821  transposase  99.67 
 
 
303 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1019  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1719    99.67 
 
 
396 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.489202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2818  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1380  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0376  transposase  99.67 
 
 
396 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.592111  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0767  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0846  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.392375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1439  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.627971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2265  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2449  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
480 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3670  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1161 bp  593  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2365  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0062    99.67 
 
 
480 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.388023  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0302  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0382  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0785  isrso15-transposase  99.67 
 
 
396 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0486589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1956  isrso15-transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2341  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0136009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2866  ISBma1, transposase  99.67 
 
 
1221 bp  593  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0496  transposase  99.34 
 
 
1221 bp  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3118  ISBma1, transposase  99.34 
 
 
1161 bp  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000303493  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0363  ISBma1, transposase  99.34 
 
 
1161 bp  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2608  ISBma1, transposase  99.01 
 
 
1161 bp  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.904926  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3044  ISBma1, transposase  99.01 
 
 
1161 bp  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932011  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1076    100 
 
 
294 bp  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0176    100 
 
 
1164 bp  482  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1347    100 
 
 
1164 bp  482  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1544    100 
 
 
1164 bp  482  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0202    100 
 
 
1164 bp  482  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00497899  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1656  ISBma1, transposase  91.75 
 
 
1161 bp  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0734  ISBma1, transposase  91.75 
 
 
1161 bp  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1538  ISBma1, transposase  91.75 
 
 
462 bp  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2583  ISBma1, transposase  91.75 
 
 
705 bp  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.116044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3132    100 
 
 
1122 bp  398  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3524  ISBma1, transposase  100 
 
 
1122 bp  398  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1961    100 
 
 
1122 bp  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.96725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3515    100 
 
 
1122 bp  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1520    100 
 
 
195 bp  387  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.230947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3811  ISBma1, transposase  99.49 
 
 
357 bp  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2573  ISRSO15-transposase protein  89.77 
 
 
1221 bp  355  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1547  ISRSO15-transposase protein  89.77 
 
 
1221 bp  355  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.355973 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6812  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  89.44 
 
 
1221 bp  347  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2899  ISBma1, transposase  100 
 
 
192 bp  329  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629889  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4778  transposase  89.93 
 
 
369 bp  329  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2902  ISBma1, transposase  100 
 
 
1062 bp  283  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0338  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  90.84 
 
 
1221 bp  165  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.913809  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0083  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  90.84 
 
 
1221 bp  165  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1291  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  90.84 
 
 
1221 bp  165  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.539924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>