299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1971 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  86.75 
 
 		 777 bp  704    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1971    100 
 
 		 774 bp  1534    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000113634  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  99.87 
 
 		 774 bp  1526    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  92.83 
 
 		 777 bp  1084    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  96.9 
 
 		 774 bp  1344    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  99.87 
 
 		 774 bp  1526    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  99.61 
 
 		 774 bp  1511    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 774 bp  1534    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  86.18 
 
 		 774 bp  674    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  91.76 
 
 		 777 bp  1017    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 774 bp  1534    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  92.05 
 
 		 774 bp  1021    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  92.16 
 
 		 777 bp  1041    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  92.16 
 
 		 777 bp  1041    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  85.66 
 
 		 774 bp  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  91.76 
 
 		 777 bp  1017    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  92.81 
 
 		 777 bp  1080    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 774 bp  1534    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  92.03 
 
 		 777 bp  1033    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  85.75 
 
 		 777 bp  628  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  86.65 
 
 		 774 bp  297  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  80.29 
 
 		 777 bp  256  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  84.48 
 
 		 777 bp  218  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  83.66 
 
 		 777 bp  210  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  85.04 
 
 		 777 bp  202  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  82.93 
 
 		 777 bp  180  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  83.04 
 
 		 777 bp  180  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6414  ABC transporter related  79.62 
 
 		 777 bp  174  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  82.19 
 
 		 783 bp  167  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  83.48 
 
 		 795 bp  155  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  82.12 
 
 		 774 bp  139  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  91.21 
 
 		 774 bp  117  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  81.78 
 
 		 774 bp  115  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  86.03 
 
 		 783 bp  103  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  86.03 
 
 		 783 bp  103  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  87.76 
 
 		 768 bp  99.6  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  86.41 
 
 		 813 bp  93.7  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  86.73 
 
 		 768 bp  91.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  91.3 
 
 		 882 bp  89.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  90.28 
 
 		 828 bp  87.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  90.28 
 
 		 828 bp  87.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  85.44 
 
 		 813 bp  85.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8310  ABC transporter related  96 
 
 		 834 bp  83.8  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.575602 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  86.02 
 
 		 771 bp  81.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  89.86 
 
 		 816 bp  81.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  87.06 
 
 		 795 bp  81.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  88.89 
 
 		 828 bp  79.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  95.83 
 
 		 732 bp  79.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  94.12 
 
 		 762 bp  77.8  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  85.26 
 
 		 831 bp  77.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  95.65 
 
 		 801 bp  75.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  94 
 
 		 786 bp  75.8  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4040  ABC transporter related  95.65 
 
 		 834 bp  75.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  91.23 
 
 		 747 bp  73.8  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3488  ABC transporter related protein  91.23 
 
 		 735 bp  73.8  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  93.88 
 
 		 762 bp  73.8  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1214  ABC transporter related  91.23 
 
 		 783 bp  73.8  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6155  ABC transporter related  93.75 
 
 		 1107 bp  71.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.587956  normal  0.435406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  91.07 
 
 		 777 bp  71.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  93.75 
 
 		 783 bp  71.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  91.07 
 
 		 756 bp  71.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  88.24 
 
 		 1005 bp  71.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1697  ABC transporter-related protein  89.06 
 
 		 1959 bp  71.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3554  ABC transporter related  88.24 
 
 		 711 bp  71.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.433786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  95.35 
 
 		 1785 bp  69.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  84.62 
 
 		 813 bp  69.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  88.06 
 
 		 1941 bp  69.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  89.83 
 
 		 801 bp  69.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  95.35 
 
 		 768 bp  69.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  95.24 
 
 		 792 bp  67.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  87.14 
 
 		 1941 bp  67.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0262  ABC transporter related  93.48 
 
 		 765 bp  67.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  95.24 
 
 		 783 bp  67.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3430  ABC transporter-like protein  97.37 
 
 		 711 bp  67.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  87.88 
 
 		 828 bp  67.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0356  ABC transporter related  93.48 
 
 		 873 bp  67.9  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  97.37 
 
 		 792 bp  67.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  92 
 
 		 813 bp  67.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4016  ABC transporter related  90.74 
 
 		 819 bp  67.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  97.37 
 
 		 792 bp  67.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  93.48 
 
 		 765 bp  67.9  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  91.84 
 
 		 792 bp  65.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3689  ABC transporter-related protein  90.57 
 
 		 759 bp  65.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  91.84 
 
 		 2523 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  90.57 
 
 		 1893 bp  65.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  87.69 
 
 		 852 bp  65.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5902  ABC transporter related  100 
 
 		 1851 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656172  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2164  ABC transporter related  90.57 
 
 		 792 bp  65.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5973  ABC transporter related  93.33 
 
 		 765 bp  65.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  86.3 
 
 		 1002 bp  65.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  91.84 
 
 		 2523 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  93.33 
 
 		 720 bp  65.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  87.5 
 
 		 930 bp  63.9  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  88.33 
 
 		 1827 bp  63.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5435  ABC transporter related  97.22 
 
 		 858 bp  63.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.545433 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  100 
 
 		 744 bp  63.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  95 
 
 		 939 bp  63.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3735  ABC transporter related  100 
 
 		 744 bp  63.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0795  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  100 
 
 		 858 bp  63.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4633  ABC transporter related  100 
 
 		 744 bp  63.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>