More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1282 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1724  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  90 
 
 
464 aa  852    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144019  hitchhiker  0.0000907891 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1451  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  87.47 
 
 
463 aa  842    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211252  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1770  sigma-54 dependent transcriptional regulator  100 
 
 
463 aa  949    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.000204714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1282  sigma-54 dependent transcriptional regulator  100 
 
 
463 aa  949    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1952  sigma-54 dependent transcriptional regulator  99.77 
 
 
435 aa  889    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000030169  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4669  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  88.59 
 
 
439 aa  691    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.47055  hitchhiker  0.00356512 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2534  sigma-54 dependent transcriptional regulator  98.16 
 
 
435 aa  876    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435051  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1040  sigma-54 interaction domain/Fis family transcriptional regulator domain-containing protein  100 
 
 
463 aa  949    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00193439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1797  sigma-54 interaction domain/Fis family transcriptional regulator domain-containing protein  99.78 
 
 
463 aa  947    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1505  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  88.98 
 
 
463 aa  847    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826842  hitchhiker  0.0000199805 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0125  sigma-54 dependent transcriptional regulator  100 
 
 
463 aa  949    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000714993  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1661  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  80.17 
 
 
463 aa  773    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.833416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2790  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  80.39 
 
 
463 aa  776    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153211  normal  0.129161 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1049  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  88.98 
 
 
463 aa  847    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.854506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1529  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  88.98 
 
 
463 aa  847    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1776  sigma-54 interaction domain/Fis family transcriptional regulator domain-containing protein  99.78 
 
 
463 aa  947    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000137503  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1411  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  87.69 
 
 
463 aa  841    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4454  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  62.74 
 
 
479 aa  581  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2062  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  58.52 
 
 
464 aa  540  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767167  normal  0.704924 
 
 
-
 
NC_003296  RS02586  sigma-54 interacting transcription regulator protein  58.13 
 
 
467 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0522958  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4366  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  57.42 
 
 
471 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  0.659948 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4256  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  57.42 
 
 
471 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118848  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3662  putative Fis family transcriptional regulator  58.15 
 
 
454 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5417  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  59.08 
 
 
456 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.468471  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2696  sigma-54 dependent transcriptional regulator  39.35 
 
 
462 aa  316  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2318  putative sigma54 specific transcriptional regulator  39.35 
 
 
462 aa  316  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.901634  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  41.54 
 
 
460 aa  227  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.99 
 
 
459 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0086  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.96 
 
 
470 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0970  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.59 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000694494  normal  0.524712 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3097  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.11 
 
 
427 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2115  response regulator receiver protein  38.81 
 
 
493 aa  213  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0922  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.73 
 
 
462 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554455  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0965  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.39 
 
 
466 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.605384  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04881  two-component system regulatory protein  39.56 
 
 
466 aa  212  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.476586  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0976  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.4 
 
 
1079 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0978  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.4 
 
 
466 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0932912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3786  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.48 
 
 
484 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.436046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1635  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.66 
 
 
457 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2035  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.54 
 
 
493 aa  210  4e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.806395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2806  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.65 
 
 
450 aa  210  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3095  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.68 
 
 
575 aa  210  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.458911 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3870  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.48 
 
 
484 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1295  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.32 
 
 
457 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62254e-16 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004047  C4-dicarboxylate transport transcriptional regulatory protein  36.69 
 
 
445 aa  209  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.114732  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2591  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.94 
 
 
457 aa  209  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313706  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0884  NifA subfamily transcriptional regulator  38.99 
 
 
539 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5854  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.89 
 
 
466 aa  209  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6033  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.68 
 
 
376 aa  209  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.516137  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1657  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.41 
 
 
456 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0365007  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2930  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.44 
 
 
457 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.17 
 
 
460 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0675  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  48.78 
 
 
579 aa  209  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.775979  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1588  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.24 
 
 
458 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_003296  RS02227  sigma-54 interacting transcription regulator protein  38.44 
 
 
384 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.05 
 
 
470 aa  208  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.66 
 
 
463 aa  208  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0874  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.78 
 
 
464 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02780  vanadium nitrogenase sigma54-dependent transcriptional activator, VnfA  38.1 
 
 
522 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2604  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.85 
 
 
459 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2600  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.32 
 
 
448 aa  206  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1054  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.76 
 
 
463 aa  206  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3404  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.82 
 
 
455 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235439  normal  0.675632 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2669  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.67 
 
 
439 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3091  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.76 
 
 
456 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.416346  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5338  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.59 
 
 
462 aa  206  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1894  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.63 
 
 
456 aa  206  8e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.410758  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4418  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.05 
 
 
466 aa  206  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1160  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.54 
 
 
475 aa  206  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3166  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.27 
 
 
457 aa  206  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521221  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2812  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.16 
 
 
466 aa  206  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2313  Fis family transcriptional regulator  36.89 
 
 
510 aa  205  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2730  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.58 
 
 
535 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.928628  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1886  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.98 
 
 
379 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1028  response regulator receiver protein  40.19 
 
 
439 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2061  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  46.64 
 
 
442 aa  206  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1624  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  37.31 
 
 
561 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.714408  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0318  Fis family transcriptional regulator  37.46 
 
 
491 aa  206  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2998  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.81 
 
 
460 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.605804 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0588  Fis family transcriptional regulator  41.28 
 
 
458 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651672  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3111  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.21 
 
 
458 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1495  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.71 
 
 
458 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.301103  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0884  transcriptional regulator FleQ  36.46 
 
 
471 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2412  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.84 
 
 
448 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408341  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49020  sigma54-dependent transcriptional activator for the iron only nitrogenase, AnfA  37.65 
 
 
537 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0674  two-component response regulator CbrB  34.34 
 
 
453 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0916838  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2713  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37 
 
 
454 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2825  Fis family transcriptional regulator  36 
 
 
589 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208492  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2347  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.69 
 
 
450 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0915  transcriptional regulator FleQ  36.46 
 
 
471 aa  204  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002811  flagellar regulatory protein FleQ  35 
 
 
488 aa  204  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2618  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.69 
 
 
453 aa  204  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3879  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.36 
 
 
365 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3768  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.36 
 
 
365 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.251278  normal  0.151277 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60260  two-component response regulator PilR  39.32 
 
 
445 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000831057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1807  two component Fis family transcriptional regulator  38.01 
 
 
440 aa  203  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2499  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.54 
 
 
448 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0553938  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3051  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.29 
 
 
477 aa  203  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0723  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.38 
 
 
444 aa  203  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.59 
 
 
458 aa  203  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>