22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0068 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0055    100 
 
 
1191 bp  1124    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0068    100 
 
 
567 bp  1124    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  99.47 
 
 
1191 bp  1096    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  99.65 
 
 
1191 bp  1104    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  100 
 
 
567 bp  1124    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  100 
 
 
567 bp  1124    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  96.13 
 
 
1191 bp  910    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  99.65 
 
 
1191 bp  1104    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  87.77 
 
 
1179 bp  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  87.94 
 
 
1179 bp  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  83.67 
 
 
1173 bp  236  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  83.67 
 
 
1173 bp  236  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  82.22 
 
 
1173 bp  196  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  80.13 
 
 
1173 bp  192  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  84.31 
 
 
1185 bp  188  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  81.4 
 
 
1173 bp  188  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  81.94 
 
 
1206 bp  165  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  81.94 
 
 
1173 bp  165  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  80.34 
 
 
1206 bp  123  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  97.56 
 
 
1194 bp  73.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  77.9 
 
 
1206 bp  61.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0033  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
579 bp  48.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519316  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>