27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0047 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0305    100 
 
 
918 bp  1302    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  100 
 
 
918 bp  1302    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0047    100 
 
 
657 bp  1302    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  100 
 
 
918 bp  1302    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  93.61 
 
 
912 bp  971    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  100 
 
 
918 bp  1302    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2434  hypothetical protein  100 
 
 
657 bp  1302    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0600  sterol desaturase family protein  100 
 
 
657 bp  1302    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  87.93 
 
 
915 bp  587  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  87.74 
 
 
915 bp  569  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  87.57 
 
 
915 bp  561  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  86.71 
 
 
915 bp  545  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  86.39 
 
 
915 bp  515  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  86.39 
 
 
915 bp  515  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  86.39 
 
 
915 bp  515  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  85.08 
 
 
966 bp  359  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  84.73 
 
 
963 bp  349  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1007  hypothetical protein  100 
 
 
1395 bp  147  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0467  hypothetical protein  86.21 
 
 
384 bp  69.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0454844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3543    85.37 
 
 
921 bp  67.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216949  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  86.57 
 
 
906 bp  61.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  92.68 
 
 
909 bp  58  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  80.83 
 
 
1020 bp  56  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  85.71 
 
 
918 bp  54  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  82.56 
 
 
960 bp  52  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1221  fatty acid hydroxylase  80.34 
 
 
906 bp  50.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  96.55 
 
 
1239 bp  50.1  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>