35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2435 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1008  sterol desaturase family protein  100 
 
 
305 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0847  sterol desaturase family protein  100 
 
 
305 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0842  sterol desaturase family protein  100 
 
 
305 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0601  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2435  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0671  sterol desaturase family protein  95.12 
 
 
303 aa  166  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5951  sterol desaturase-like  86.08 
 
 
304 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2667  sterol desaturase-like protein  84.81 
 
 
304 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2540  fatty acid hydroxylase  84.81 
 
 
304 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  83.54 
 
 
304 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2649  fatty acid hydroxylase  81.01 
 
 
304 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2009  sterol desaturase-like  81.01 
 
 
304 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2620  sterol desaturase-like protein  81.01 
 
 
304 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3269  fatty acid hydroxylase  71.95 
 
 
320 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0467  hypothetical protein  69.14 
 
 
127 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0454844 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0697  hypothetical protein  69.51 
 
 
321 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2023  sterol desaturase-like protein  54.17 
 
 
322 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1130  fatty acid hydroxylase  49.32 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1221  fatty acid hydroxylase  50.68 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.387146  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3109  sterol desaturase family protein  42.03 
 
 
292 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0789  sterol desaturase family protein  38.57 
 
 
287 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0818  sterol desaturase family protein  38.57 
 
 
287 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  37.97 
 
 
304 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3594  sterol desaturase family protein  41.54 
 
 
288 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3618  hypothetical protein  35.82 
 
 
274 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246292  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3149  sterol desaturase family protein  37.14 
 
 
287 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3717  sterol desaturase family protein  41.54 
 
 
288 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  41.54 
 
 
288 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2550  sterol desaturase family protein  36.23 
 
 
287 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  46.15 
 
 
270 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3525  fatty acid hydroxylase  41.54 
 
 
288 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0825  sterol desaturase family protein  40 
 
 
287 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  34.78 
 
 
271 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3108  fatty acid hydroxylase  38.46 
 
 
315 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  35.29 
 
 
285 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>