292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0137 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1475  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0137  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 
284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0510  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 
284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1395  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  99.65 
 
 
304 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.553188  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2305  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  93.15 
 
 
309 aa  480  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0992  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  93.49 
 
 
289 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0799157  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1075  cyclic nucleotide-binding protein  97.18 
 
 
281 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1687  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  84.86 
 
 
299 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535238  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1725  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  81.7 
 
 
251 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.134143  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4190  cyclic nucleotide-binding protein  72.06 
 
 
262 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456577  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3712  cyclic nucleotide-binding protein  72.12 
 
 
259 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  74.31 
 
 
248 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.778441  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4072  cyclic nucleotide-binding protein  80.18 
 
 
247 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.426596  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3223  cyclic nucleotide-binding protein  79.73 
 
 
247 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.319468 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4294  cyclic nucleotide-binding protein  80.18 
 
 
247 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.803161  normal  0.987027 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6768  cyclic nucleotide-binding protein  71.15 
 
 
248 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4311  cyclic nucleotide-binding protein  79.91 
 
 
285 aa  362  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0853188  normal  0.342841 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5767  putative HTH Crp family transcriptional regulator  57.78 
 
 
253 aa  268  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4309  cyclic nucleotide-binding  59.53 
 
 
232 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0018  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.6 
 
 
232 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0023  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  57.67 
 
 
232 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0213  cyclic nucleotide-binding protein  48.85 
 
 
259 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0259  cyclic nucleotide-binding protein  48.18 
 
 
222 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0248  cyclic nucleotide-binding  45.5 
 
 
224 aa  195  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4295  Crp/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 
265 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5005  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.12 
 
 
261 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62031  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0464  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.34 
 
 
272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0498511  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6150  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.82 
 
 
226 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0473  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.34 
 
 
272 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5944  cyclic nucleotide-binding  42.92 
 
 
228 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0605  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.89 
 
 
252 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0681  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.75 
 
 
234 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0670228  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3605  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
235 aa  185  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.391558 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4138  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.72 
 
 
234 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.60462  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4026  cyclic nucleotide-binding protein  43.72 
 
 
234 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3543  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
236 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3433  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.75 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00135571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1160  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
242 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.38 
 
 
230 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5713  transcriptional regulator  40.93 
 
 
224 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.89 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647195  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0075  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.43 
 
 
236 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2580  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0608  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.65 
 
 
161 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2394  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0405792  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3781  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.29 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.71 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4858  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.29 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.748285 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2959  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
241 aa  96.3  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3075  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
239 aa  95.9  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.44 
 
 
239 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370075  normal  0.683237 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3326  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 
239 aa  93.6  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 
239 aa  93.2  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4308  cyclic nucleotide-binding protein  27.4 
 
 
239 aa  92.8  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411784  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1913  CRP/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 
241 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.205993  normal  0.953786 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7045  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.28 
 
 
237 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  0.0108856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4994  cyclic nucleotide-binding protein  28.31 
 
 
247 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103725  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0027  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
237 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01902  putative transcription regulator protein  30.87 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.03 
 
 
243 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.03 
 
 
243 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4881  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1058  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0976  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.49 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0894  cyclic nucleotide-binding  28.88 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.12 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1379  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231738  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.62 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2143  putative transcriptional regulator  27.23 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0938  cyclic nucleotide-binding protein  27.23 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2266  transcriptional regulator, putative  27.23 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1089  cyclic nucleotide-binding protein  27.23 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  27.23 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0934  cyclic nucleotide-binding  27.23 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.059861  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4353  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
227 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.26 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  25.49 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2459  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
235 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341213 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2565  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.52 
 
 
235 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0695171  normal  0.0307054 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.16 
 
 
228 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.7 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.09 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2589  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.52 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679634  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0199  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
227 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5872  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142608  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.17 
 
 
226 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
235 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.027549  normal  0.149867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03580  putative transcriptional regulator  25.71 
 
 
228 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000980911  hitchhiker  0.0000000000977836 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2608  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
239 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.700213  normal  0.0258786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.41 
 
 
226 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  25 
 
 
224 aa  62  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1929  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.52 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.589711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2541  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.52 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000812643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0351  putative transcriptional regulator  25.71 
 
 
228 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2665  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0675619  normal  0.290328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
225 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>