169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0820 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0820    100 
 
 		 2213 bp  4387    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00176138  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1737  glycogen branching enzyme  99.55 
 
 		 2217 bp  4314    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  83.77 
 
 		 2208 bp  1287    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  84.72 
 
 		 2211 bp  1340    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5592  glycogen branching enzyme  83.01 
 
 		 2202 bp  1138    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  84.78 
 
 		 2211 bp  1348    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1338  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 1347 bp  2670    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1339  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 849 bp  1683    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0535  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 849 bp  1683    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0536  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 1347 bp  2670    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1543  glycogen branching enzyme  99.46 
 
 		 2217 bp  4298    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408672  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1566  glycogen branching enzyme  99.55 
 
 		 2217 bp  4314    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0620    100 
 
 		 2213 bp  4387    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.066303  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5489  glycogen branching enzyme  84.82 
 
 		 2199 bp  1320    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461102  decreased coverage  0.0000652942 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  84.55 
 
 		 2211 bp  1330    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6322  glycogen branching enzyme  82.55 
 
 		 2202 bp  1090    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529539  normal  0.166008 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  85.32 
 
 		 2328 bp  224  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4391  glycogen branching enzyme  80.7 
 
 		 2226 bp  220  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.470909 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  86.61 
 
 		 2211 bp  190  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  83.84 
 
 		 2313 bp  176  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  83 
 
 		 2307 bp  174  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1978  glycogen branching enzyme  89.09 
 
 		 1899 bp  168  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  83.39 
 
 		 2283 bp  168  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  85.27 
 
 		 2211 bp  167  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  83.11 
 
 		 2187 bp  163  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  89.1 
 
 		 2253 bp  159  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  81.33 
 
 		 2505 bp  151  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  87.8 
 
 		 2358 bp  151  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  84.54 
 
 		 2307 bp  147  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  84.54 
 
 		 2307 bp  147  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2046  1,4-alpha-glucan branching enzyme  86.06 
 
 		 2193 bp  145  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.026483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  87.27 
 
 		 2358 bp  145  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  81.76 
 
 		 2151 bp  143  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  81.43 
 
 		 2034 bp  143  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  80.4 
 
 		 2202 bp  135  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  85.35 
 
 		 1878 bp  129  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1334  1,4-alpha-glucan branching enzyme  80.49 
 
 		 2232 bp  125  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0840  glycogen branching enzyme  84.66 
 
 		 1932 bp  125  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.049249 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  84.02 
 
 		 2190 bp  121  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  86.49 
 
 		 2187 bp  119  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  80.14 
 
 		 2169 bp  115  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  86.62 
 
 		 2250 bp  115  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2936  1,4-alpha-glucan branching enzyme  84.18 
 
 		 2166 bp  113  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  84.85 
 
 		 2355 bp  113  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  84.85 
 
 		 2355 bp  113  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  82.95 
 
 		 2211 bp  111  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  85.81 
 
 		 2187 bp  111  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  83.8 
 
 		 2151 bp  109  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  91.57 
 
 		 2178 bp  109  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  82.58 
 
 		 2181 bp  107  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  84.57 
 
 		 2187 bp  107  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03850  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  82.53 
 
 		 2331 bp  99.6  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.914445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  83.22 
 
 		 2199 bp  97.6  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1464  1,4-alpha-glucan branching enzyme  93.85 
 
 		 2229 bp  97.6  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  79.36 
 
 		 2199 bp  97.6  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  84.09 
 
 		 2196 bp  95.6  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  85.98 
 
 		 2211 bp  93.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0223  glycogen branching enzyme  86.27 
 
 		 2184 bp  91.7  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  85.45 
 
 		 3963 bp  91.7  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  83.1 
 
 		 2211 bp  91.7  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  83.72 
 
 		 2088 bp  89.7  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  84 
 
 		 2232 bp  89.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  87.5 
 
 		 2151 bp  87.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0277  glycogen branching enzyme  81.55 
 
 		 2184 bp  87.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  85.05 
 
 		 2211 bp  85.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  97.87 
 
 		 2208 bp  85.7  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  83.02 
 
 		 2151 bp  85.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  83.02 
 
 		 2139 bp  85.7  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  82 
 
 		 2250 bp  83.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  82.53 
 
 		 2223 bp  83.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  84.55 
 
 		 2184 bp  83.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  80.46 
 
 		 2268 bp  83.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  81.7 
 
 		 2208 bp  81.8  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  91.8 
 
 		 2247 bp  81.8  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  92.98 
 
 		 2469 bp  81.8  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  87.5 
 
 		 2439 bp  79.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  84.62 
 
 		 2187 bp  79.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4103  1,4-alpha-glucan branching enzyme  82.54 
 
 		 2874 bp  77.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  87.34 
 
 		 2247 bp  77.8  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  83.64 
 
 		 2280 bp  75.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  83.64 
 
 		 2280 bp  75.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  83.64 
 
 		 2280 bp  75.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  83.05 
 
 		 2139 bp  75.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  89.39 
 
 		 2244 bp  75.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  89.23 
 
 		 2151 bp  73.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  97.56 
 
 		 2178 bp  73.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  89.23 
 
 		 2265 bp  73.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000057482  decreased coverage  0.000000447753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0415  1,4-alpha-glucan branching enzyme  93.88 
 
 		 2172 bp  73.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  92.31 
 
 		 2226 bp  71.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  92.31 
 
 		 2226 bp  71.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  95.45 
 
 		 2217 bp  71.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  93.75 
 
 		 2199 bp  71.9  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  95.35 
 
 		 2223 bp  69.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  95.35 
 
 		 1980 bp  69.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3771  1,4-alpha-glucan branching enzyme  97.44 
 
 		 1845 bp  69.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  93.62 
 
 		 1923 bp  69.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2421  1,4-alpha-glucan branching enzyme  88.06 
 
 		 2241 bp  69.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  86.67 
 
 		 1866 bp  69.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0752  glycogen branching enzyme  92 
 
 		 2253 bp  67.9  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 2199 bp  67.9  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>