96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_t0037 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_t0037  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1357  tRNA-Glu  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0016  tRNA-Glu  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.671374  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0015  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.879975  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0046  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.404692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0045  tRNA-Glu  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.427459  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18600  tRNA-Glu  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204503  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34010  tRNA-Glu  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284833  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18590  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.2903  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0006  tRNA-Glu  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766786  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0005  tRNA-Glu  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334016 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0059  tRNA-Glu  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.872199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0053  tRNA-Glu  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.526279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0055  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0094  tRNA-Glu  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.115481  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0002  tRNA-Glu  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12539  normal  0.0346433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0022  tRNA-Glu  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0070  tRNA-Glu  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.251867  normal  0.130321 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0048  tRNA-Glu  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.849322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0084  tRNA-Glu  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0023  tRNA-Glu  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707978  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0030  tRNA-Glu  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.437879  normal  0.359781 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0057  tRNA-Glu  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0731133  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0060  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0058  tRNA-Glu  87.14 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000216318  unclonable  0.00000608893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37130  tRNA-Glu  86.36 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.179999  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0030  tRNA-Glu  86.36 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0242042  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0032  tRNA-Glu  86.36 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00151707  hitchhiker  0.000680514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0029  tRNA-Glu  86.36 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  hitchhiker  0.000705455 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0006  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0052  tRNA-Glu  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.699751  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0061  tRNA-Glu  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180901  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0072  tRNA-Glu  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.514054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0052  tRNA-Glu  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0066  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000193579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0015  tRNA-Glu  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0034  tRNA-Glu  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0012  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.12218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0056  tRNA-Glu  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0053  tRNA-Glu  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0004  tRNA-Glu  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0017  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0055  tRNA-Glu  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0036  tRNA-Glu  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.661246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0014  tRNA-Glu  84.51 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178243  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0062  tRNA-Glu  84.51 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.427189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0014  tRNA-Glu  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.206321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0077  tRNA-Glu  84.51 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0013  tRNA-Glu  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0083  tRNA-Glu  84.51 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0031  tRNA-Glu  85.92 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0217674  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0047  tRNA-Glu  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.792355  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0013  tRNA-Glu  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0017  tRNA-Glu  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0035  tRNA-Glu  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.461495  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0010  tRNA-Glu  84.51 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0067  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000153878  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0009  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.250307  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0043  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000194529  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0017  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1600  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t34  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0061  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0014  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.372263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0015  tRNA-Glu  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0021  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0013  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.330262 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0058  tRNA-Glu  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14035  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00157329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0050  tRNA-Glu  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0043  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0981603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0029  tRNA-Glu  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0024  tRNA-Glu  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.574829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0043  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0945053  normal  0.0751648 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0106  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.608719  normal  0.0144699 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0052  tRNA-Glu  83.33 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0059  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.935915 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0007  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.466736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0034  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08670  tRNA-Glu  85 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0059  tRNA-Glu  83.1 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0046  tRNA-Glu  83.1 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0002  tRNA-Glu  83.1 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.509318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0056  tRNA-Glu  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116328  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1796  tRNA-Glu  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0052  tRNA-Glu  84.29 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393318  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0015  tRNA-Glu  84.29 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000362214  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0045  tRNA-Glu  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0700385  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0015  tRNA-Glu  84.29 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.679180000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0034  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0629823  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0041  tRNA-Glu  83.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119319  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0032  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.449659  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0052  tRNA-Glu  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>