250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_t0006 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1383  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0556361 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0006  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000876762  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1388  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.276257 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0010  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000890025  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0028  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000389832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15490  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0014086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15520  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0825  tRNA-Gly  90.16 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.364778  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0039  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0043  tRNA-Gly  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0822724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0019  tRNA-Gly  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00502278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna21  tRNA-Gly  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0041  tRNA-Gly  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0051  tRNA-Gly  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0500664 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0006  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0042  tRNA-Gly  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna23  tRNA-Gly  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0044  tRNA-Gly  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0345012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0055  tRNA-Gly  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.835398  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0054  tRNA-Gly  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0271354  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0008  tRNA-Gly  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0033  tRNA-Gly  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.688616  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0007  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38046  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0008  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.521069  normal  0.137143 
 
 
-
 
NC_003295  RS04003  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000136534  normal  0.315468 
 
 
-
 
NC_003295  RS04004  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000202158  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0011  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0032  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165397  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0034  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0036  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0045  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0047  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.686497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0035  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0039  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0037  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.694382  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0010  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0183648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0037  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0037  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0036  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0039  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169853  normal  0.361721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0049  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00162631  normal  0.347035 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0051  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000327476  normal  0.339785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0037  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0036  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0050  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00077941  normal  0.344918 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051021  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0495451  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0037  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0038  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0068  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00512241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2881  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2882  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0037  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0043  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00341468  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0044  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.013329  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0045  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960605  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0035  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0038  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.351853 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0036  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.19079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0035  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1741  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0350949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1742  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0559851  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0056  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00797069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0057  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000972569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0039  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00658177  decreased coverage  0.00000286482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0040  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00614875  decreased coverage  0.00000263085 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0019  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0020  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0021  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.168076  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0035  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000173498  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0036  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000574217  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0037  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000566615  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0033  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100821  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0034  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.205379  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0035  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0035  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2454  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.880044  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2826  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0217259  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2827  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0128974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2766  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0786611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2767  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0513521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2826  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2827  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1777  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00314954  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0036  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0018  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.642643  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0020  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.880732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0001  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0037  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0038  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0040  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291928 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0013  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0045  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.970525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0011  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0013  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.155997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0023  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0015  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.750891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0017  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.725163  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0061  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0898081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>