More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0379 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0379  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347457  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1829  chromosome partitioning ATPase  48.74 
 
 
278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00367094  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.95 
 
 
192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4261  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.68 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.86 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1536  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.88 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116113  normal  0.228673 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0386  chromosome partitioning ATPase  36.94 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.136541  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  34.62 
 
 
223 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.14 
 
 
223 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.14 
 
 
223 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.94 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3315  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.21 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.52 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.52 
 
 
217 aa  67.8  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  41.53 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.82 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.89 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.08 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.77 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.71 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0129  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.46 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.91 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.02 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.52 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.91 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.76 
 
 
211 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.22 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.32 
 
 
232 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.32 
 
 
232 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.71 
 
 
217 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.71 
 
 
217 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.1 
 
 
212 aa  62.4  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  31.67 
 
 
209 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.34 
 
 
211 aa  61.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  34.96 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.2 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  39.06 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.06 
 
 
211 aa  59.7  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.67 
 
 
212 aa  59.7  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.84 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.3 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.37 
 
 
217 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.4 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  26.73 
 
 
219 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.14 
 
 
211 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.65 
 
 
251 aa  58.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
216 aa  58.5  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.9 
 
 
209 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.51 
 
 
217 aa  58.2  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.18 
 
 
214 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.64 
 
 
212 aa  57.8  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  31.11 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.48 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  30.38 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  31.33 
 
 
309 aa  57.4  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.07 
 
 
229 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.65 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.84 
 
 
232 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.84 
 
 
237 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.71 
 
 
220 aa  55.8  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.98 
 
 
238 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2658  hypothetical protein  25.43 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.43 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.58 
 
 
232 aa  54.7  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  30.77 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.29 
 
 
222 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.89 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  31.9 
 
 
252 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.04 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.59 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  29.63 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2866  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.36 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.36 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110983  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.05 
 
 
256 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.08 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  30.82 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.43 
 
 
216 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.65 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  29.17 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.15 
 
 
213 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.85 
 
 
257 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.81 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.32 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.11 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  30.34 
 
 
254 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.8 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  31.51 
 
 
256 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.8 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  25.93 
 
 
228 aa  50.1  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.88 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.8 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.8 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  30.25 
 
 
265 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.8 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.8 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.32 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  25.79 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  39.2 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.529714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>