More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0396 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1405  methionyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 		 678 aa  705    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.341077  normal  0.644842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02044  methionyl-tRNA synthetase  70.57 
 
 		 677 aa  840    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1543  methionyl-tRNA synthetase  70.38 
 
 		 677 aa  840    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.164847  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1137  methionyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 		 710 aa  694    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2300  methionyl-tRNA synthetase  70.75 
 
 		 677 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 		 689 aa  732    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1097  methionyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 679 aa  697    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.915405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2554  methionyl-tRNA synthetase  71.25 
 
 		 675 aa  848    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1287  methionyl-tRNA synthetase  72.16 
 
 		 676 aa  863    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.742369  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1573  methionyl-tRNA synthetase  71.25 
 
 		 675 aa  848    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.960021  normal  0.561708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2839  methionyl-tRNA synthetase  61.11 
 
 		 713 aa  736    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3097  methionyl-tRNA synthetase  70.57 
 
 		 677 aa  842    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  60.41 
 
 		 676 aa  738    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4147  methionyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 682 aa  694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 		 689 aa  732    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1053  methionyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 685 aa  642    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.531844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  59.52 
 
 		 673 aa  744    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2249  methionyl-tRNA synthetase  70.57 
 
 		 677 aa  841    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1126  methionyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 		 681 aa  696    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2873  methionyl-tRNA synthetase  70.59 
 
 		 677 aa  850    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2941  methionyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 670 aa  656    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2795  methionyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 670 aa  655    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1195  methionyl-tRNA synthetase  70.4 
 
 		 676 aa  845    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3886  methionyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 		 682 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.444378 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1432  methionyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 		 700 aa  636    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.111821  normal  0.539533 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3044  methionyl-tRNA synthetase  71.98 
 
 		 676 aa  861    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1533  methionyl-tRNA synthetase  70.57 
 
 		 677 aa  841    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 		 689 aa  732    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 674 aa  665    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4507  methionyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 		 683 aa  684    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2389  methionyl-tRNA synthetase  70.75 
 
 		 677 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19280  methionyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 		 681 aa  689    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02927  methionyl-tRNA synthetase  63.72 
 
 		 661 aa  741    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  59.52 
 
 		 679 aa  736    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002981  methionyl-tRNA synthetase  65.68 
 
 		 691 aa  790    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.869947  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 680 aa  660    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  60.77 
 
 		 689 aa  742    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0308  methionyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 546 aa  640    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  57.33 
 
 		 678 aa  685    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02002  hypothetical protein  70.57 
 
 		 677 aa  840    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.701484  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2721  methionyl-tRNA synthetase  70.75 
 
 		 680 aa  847    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2404  methionyl-tRNA synthetase  70.57 
 
 		 677 aa  842    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3197  methionyl-tRNA synthetase  71.43 
 
 		 675 aa  850    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000166166  decreased coverage  0.00110356 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2455  methionyl-tRNA synthetase  71.43 
 
 		 675 aa  851    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2398  methionyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 677 aa  648    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.323766  normal  0.502216 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 692 aa  651    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 692 aa  651    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2501  methionyl-tRNA synthetase  70.57 
 
 		 677 aa  840    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2056  methionyl-tRNA synthetase  59.52 
 
 		 689 aa  736    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.566745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  60.62 
 
 		 692 aa  738    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2120  methionyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 681 aa  678    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0396  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 547 aa  1143    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.489581  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 679 aa  636    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  57.99 
 
 		 698 aa  704    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 675 aa  714    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4315  methionyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 679 aa  695    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0856  methionyl-tRNA synthetase  70.57 
 
 		 677 aa  843    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  59.85 
 
 		 689 aa  730    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1179  methionyl-tRNA synthetase  63.28 
 
 		 683 aa  768    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  60.41 
 
 		 676 aa  739    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  60.77 
 
 		 676 aa  743    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0817  methionyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 		 675 aa  652    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 683 aa  727    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2393  methionyl-tRNA synthetase  70.75 
 
 		 677 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19050  methionyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 678 aa  690    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.153863 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  54.16 
 
 		 680 aa  654    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1644  methionyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 679 aa  689    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2344  methionyl-tRNA synthetase  70.75 
 
 		 677 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0929  methionyl-tRNA synthetase  70.57 
 
 		 677 aa  842    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  60.59 
 
 		 676 aa  742    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  60.07 
 
 		 688 aa  735    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  65.56 
 
 		 731 aa  786    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1883  methionyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 546 aa  641    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 		 686 aa  782    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 675 aa  739    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1546  methionyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 		 678 aa  682    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229818  hitchhiker  0.00141555 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  60.74 
 
 		 686 aa  737    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  53.38 
 
 		 678 aa  628  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1709  methionyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 697 aa  629  1e-179  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0016  methionyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 694 aa  627  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 		 690 aa  625  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1596  methionyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 700 aa  625  1e-178  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0255918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 678 aa  623  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 678 aa  623  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01790  methionyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 694 aa  598  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0911016  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0574  methionyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 		 696 aa  595  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0911876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1678  methionyl-tRNA synthetase  51.47 
 
 		 702 aa  594  1e-168  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1753  methionyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 702 aa  590  1e-167  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2381  methionyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 688 aa  587  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173076  hitchhiker  0.00746029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2594  methionyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 710 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.156229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2190  methionyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 709 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.250508 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2350  methionyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 720 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145755  normal  0.0876744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1856  methionyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 686 aa  581  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00031284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1826  methionyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 718 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0136637  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2484  methionyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 720 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.735844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2437  methionyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 718 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2442  methionyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 716 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000739386  normal  0.856672 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0857  methionyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 722 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000674462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2769  methionyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 690 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.537254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3483  methionyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 710 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000647027  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>