19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0034 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0034    100 
 
 
759 bp  1505    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0502  hypothetical protein  85.39 
 
 
855 bp  73.8  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1156  hypothetical protein  85.39 
 
 
855 bp  73.8  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0438  hypothetical protein  85.39 
 
 
855 bp  73.8  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0278  hypothetical protein  83.17 
 
 
858 bp  65.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.532116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0271  hypothetical protein  91.49 
 
 
858 bp  61.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1178  hypothetical protein  85.14 
 
 
861 bp  60  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3660  hypothetical protein  90.91 
 
 
855 bp  56  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3818  hypothetical protein  90.91 
 
 
855 bp  56  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.564753  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3398  hypothetical protein  82.5 
 
 
855 bp  48.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3693  hypothetical protein  82.5 
 
 
855 bp  48.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4370  hypothetical protein  82.5 
 
 
855 bp  48.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.473818  normal  0.781233 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0502  conserved hypothetical protein  82.5 
 
 
855 bp  48.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0495  hypothetical protein  82.5 
 
 
855 bp  48.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.469234  normal  0.256599 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3501  hypothetical protein  82.5 
 
 
855 bp  48.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3565  hypothetical protein  82.5 
 
 
855 bp  48.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4527  hypothetical protein  82.5 
 
 
855 bp  48.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03021  hypothetical protein  82.5 
 
 
855 bp  48.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03070  hypothetical protein  82.5 
 
 
855 bp  48.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.776698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>