60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_0046 on replicon NC_011775
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011775  BCG9842_0046  host factor Hfq  100 
 
 		 83 aa  168  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.189654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11580  RNA chaperone Hfq  35.53 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1272  RNA-binding protein Hfq  34.21 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1493  RNA-binding protein Hfq  31.94 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.964703  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1451  RNA-binding protein Hfq  31.94 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0310898 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2843  RNA-binding protein Hfq  31.94 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.736896  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1356  RNA-binding protein Hfq  31.94 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.950341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1363  RNA chaperone Hfq  31.08 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000865539  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1389  RNA chaperone Hfq  31.08 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4124  RNA-binding protein Hfq  31.94 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304133  normal  0.524604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2610  RNA-binding protein Hfq  29.17 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0251  RNA-binding protein Hfq  31.08 
 
 		 160 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222579  normal  0.069598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2244  RNA-binding protein Hfq  30.56 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0488883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0871  host factor-I protein, putative  27.85 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.942463  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1567  RNA-binding protein Hfq  30.56 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104021  normal  0.0520931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4393  RNA chaperone Hfq  27.4 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2390  RNA-binding protein Hfq  31.88 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000174663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3478  RNA-binding protein Hfq  31.88 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000029119  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1308  RNA chaperone Hfq  36.62 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.628596  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2867  RNA-binding protein Hfq  27.78 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.648341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3763  RNA-binding protein Hfq  31.88 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3812  RNA-binding protein Hfq  31.88 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000446161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1490  RNA-binding protein Hfq  31.88 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000177401  normal  0.0133073 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3722  RNA-binding protein Hfq  31.88 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.2599e-36 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3740  RNA-binding protein Hfq  31.88 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000182671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4073  RNA-binding protein Hfq  29.17 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613894 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1449  RNA-binding protein Hfq  29.17 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.083877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3842  RNA-binding protein Hfq  31.88 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000757377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3472  RNA-binding protein Hfq  31.88 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3458  RNA-binding protein Hfq  31.88 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000205772  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2878  RNA-binding protein Hfq  27.78 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1841  RNA-binding protein Hfq  29.17 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2594  RNA-binding protein Hfq  27.78 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.852993  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2582  RNA-binding protein Hfq  27.78 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233324  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3559  RNA-binding protein Hfq  31.88 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538882  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1448  RNA-binding protein Hfq  29.17 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.581854  hitchhiker  0.000378907 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1632  RNA-binding protein Hfq  28.77 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614603  normal  0.460004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1931  RNA-binding protein Hfq  29.58 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1111  RNA-binding protein Hfq  28.77 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2208  RNA-binding protein Hfq  28.77 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1095  RNA-binding protein Hfq  28.77 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1819  RNA-binding protein Hfq  28.77 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798062  normal  0.0504163 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1070  RNA-binding protein Hfq  28.77 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0624  RNA-binding protein Hfq  28.77 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00135703  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2139  RNA chaperone Hfq  27.4 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3051  RNA chaperone Hfq  27.78 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1490  RNA chaperone Hfq  34.78 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0924374  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1230  RNA chaperone Hfq  31.94 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2942  RNA chaperone Hfq  27.78 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5537  RNA chaperone Hfq  31.08 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2824  RNA chaperone Hfq  27.78 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3124  RNA chaperone Hfq  28.57 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1613  RNA-binding protein Hfq  28.77 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1306  uncharacterized host factor I protein  27.14 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.97567e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5942  RNA chaperone Hfq  29.17 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1493  RNA chaperone Hfq  29.17 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579375  normal  0.208589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6544  RNA chaperone Hfq  29.17 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0482  RNA chaperone Hfq  29.49 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.393175  hitchhiker  0.000910775 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1762  RNA chaperone Hfq  28.77 
 
 		 175 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.683558  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0206  hypothetical protein  41.43 
 
 		 61 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0203369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>