160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4103 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A4145  2,3-diketo-5-methylthiopentyl-1-phosphate enolase  98.07 
 
 
414 aa  823    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0141097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4103  2,3-diketo-5-methylthiopentyl-1-phosphate enolase  100 
 
 
414 aa  837    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.325839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3946  2,3-diketo-5-methylthiopentyl-1-phosphate enolase  97.1 
 
 
414 aa  818    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3778  2,3-diketo-5-methylthiopentyl-1-phosphate enolase  97.1 
 
 
414 aa  819    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.659425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3793  2,3-diketo-5-methylthiopentyl-1-phosphate enolase  97.34 
 
 
414 aa  818    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00837999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4167  2,3-diketo-5-methylthiopentyl-1-phosphate enolase  98.79 
 
 
414 aa  827    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000888995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4255  2,3-diketo-5-methylthiopentyl-1-phosphate enolase  97.1 
 
 
414 aa  818    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4057  2,3-diketo-5-methylthiopentyl-1-phosphate enolase  97.34 
 
 
414 aa  820    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1093  2,3-diketo-5-methylthiopentyl-1-phosphate enolase  97.1 
 
 
414 aa  816    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2735  2,3-diketo-5-methylthiopentyl-1-phosphate enolase  82.61 
 
 
414 aa  706    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000131902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3865  2,3-diketo-5-methylthiopentyl-1-phosphate enolase  91.06 
 
 
414 aa  767    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.581822  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0850  2,3-diketo-5-methylthiopentyl-1-phosphate enolase  68.14 
 
 
413 aa  551  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000268657  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1745  2,3-diketo-5-methylthiopentyl-1-phosphate enolase  64.71 
 
 
413 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0096  2,3-diketo-5-methylthiopentyl-1-phosphate enolase  44.36 
 
 
411 aa  312  6.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0453072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0958  Ribulose-bisphosphate carboxylase  39.13 
 
 
387 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2072  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  41.71 
 
 
361 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2096  Ribulose-bisphosphate carboxylase  41.71 
 
 
361 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0596  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  36.36 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.582324  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0434  ribulose bisphosphate carboxylase, large subunit 2  36.36 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0013  Ribulose-bisphosphate carboxylase  34.01 
 
 
428 aa  213  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0258  Ribulose-bisphosphate carboxylase  34.3 
 
 
399 aa  207  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1616  ribulose-bisphosphate carboxylase  31.54 
 
 
390 aa  187  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.43252  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2315  ribulose-bisphosphate carboxylase  32.46 
 
 
399 aa  183  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1084  ribulose bisphosphate carboxylase, type III  31.88 
 
 
420 aa  181  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.518346  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0558  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit  30.77 
 
 
403 aa  169  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0297277 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1863  ribulose bisphosphate carboxylase, type III  27.58 
 
 
421 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0732  ribulose bisphosphate carboxylase, type III  28.18 
 
 
418 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0902  ribulose bisophosphate carboxylase  28.02 
 
 
428 aa  147  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1373  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  28.72 
 
 
551 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1640  ribulose-bisphosphate carboxylase large chain  31.25 
 
 
432 aa  143  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1894  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  30.82 
 
 
377 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0412  ribulose-bisphosphate carboxylase  33.23 
 
 
442 aa  140  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2007  Ribulose-bisphosphate carboxylase  32.12 
 
 
428 aa  137  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.167441 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1970  Ribulose-bisphosphate carboxylase  31.37 
 
 
433 aa  137  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2334  Ribulose-bisphosphate carboxylase  32.7 
 
 
433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903327  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1846  ribulose-bisphosphate carboxylase  26.65 
 
 
425 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0119107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2766  ribulose bisophosphate carboxylase  26.65 
 
 
423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0553432  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0902  ribulose-bisphosphate carboxylase  30.03 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1168  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  28.33 
 
 
365 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.275807 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1801  Ribulose-bisphosphate carboxylase  31.38 
 
 
428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.48391 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2001  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  31.42 
 
 
438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000765161  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0300  rubisco-like protein Rlp2  28.9 
 
 
431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.920574  normal  0.0975511 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1739  Ribulose-bisphosphate carboxylase  27.27 
 
 
421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000802921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1448  Ribulose-bisphosphate carboxylase  28.73 
 
 
420 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2026  Ribulose-bisphosphate carboxylase  28.73 
 
 
420 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197307  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5642  ribulose-bisphosphate carboxylase  27.96 
 
 
424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.741434  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32608  predicted protein  27.4 
 
 
679 aa  126  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  normal  0.0329411 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0322  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  26.92 
 
 
363 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.282033  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1325  ribulose bisophosphate carboxylase  27.12 
 
 
430 aa  126  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1105  ribulose bisophosphate carboxylase  27.62 
 
 
430 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3435  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  29.24 
 
 
428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133451  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3120  ribulose-bisphosphate carboxylase  27.66 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000815521 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0467  ribulose-bisphosphate carboxylase  28.52 
 
 
369 aa  120  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4835  ribulose bisphosphate carboxylase large chain  29.21 
 
 
371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0462  ribulose-bisphosphate carboxylase  27.48 
 
 
432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.105525 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3215  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit  28.45 
 
 
429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0263  RiBisCO-like protein  29.34 
 
 
432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.724133  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88029  predicted protein  28.11 
 
 
741 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0692998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2747  Ribulose-bisphosphate carboxylase  28.61 
 
 
416 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.32552  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0252  ribulose-bisphosphate carboxylase  29.71 
 
 
433 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.243634  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7230  Ribulose-bisphosphate carboxylase  26.43 
 
 
432 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1732  ribulose-bisphosphate carboxylase  28.26 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2420  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  28.43 
 
 
414 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0441  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit  26.04 
 
 
432 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5257  ribulose-bisphosphate carboxylase  28.1 
 
 
425 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1227  ribulose bisophosphate carboxylase  25.75 
 
 
443 aa  106  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1945  Ribulose-bisphosphate carboxylase  27.87 
 
 
423 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3724  ribulose-bisphosphate carboxylase  24.82 
 
 
418 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.630821  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2233  ribulose-bisphosphate carboxylase-like protein; rubisco-like protein  30.66 
 
 
367 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3227  rubisco-like protein Rlp1  30.88 
 
 
367 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1426  ribulose bisophosphate carboxylase  26.04 
 
 
472 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4762  Ribulose-bisphosphate carboxylase  25 
 
 
418 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521713  normal  0.838014 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2322  ribulose bisphosphate carboxylase  25.06 
 
 
474 aa  100  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2924  ribulose-bisphosphate carboxylase  25.85 
 
 
414 aa  99.8  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4649  Ribulose-bisphosphate carboxylase  25 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.175751  normal  0.655836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0032  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  26.52 
 
 
428 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.729398  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0093  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  26.51 
 
 
413 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1067  ribulose-bisphosphate carboxylase  28.7 
 
 
421 aa  99  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782005  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3067  ribulose-bisphosphate carboxylase  24.25 
 
 
418 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3063  ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase large subunit  26.67 
 
 
392 aa  96.7  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.17372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2138  Ribulose-bisphosphate carboxylase  25.62 
 
 
420 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.763721  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4410  ribulose bisophosphate carboxylase  25.78 
 
 
476 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2453  ribulose bisophosphate carboxylase  28.24 
 
 
499 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182624 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4332  ribulose bisophosphate carboxylase  25 
 
 
473 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0451  ribulose bisophosphate carboxylase  28.76 
 
 
488 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0411359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3907  ribulose bisophosphate carboxylase  25 
 
 
476 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2153  ribulose-bisphosphate carboxylase  25.26 
 
 
476 aa  89.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3924  ribulose bisophosphate carboxylase  27.6 
 
 
486 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3422  ribulose bisophosphate carboxylase  25.52 
 
 
476 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.804986  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2184  ribulose 1 5-bisphosphate carboxylase large subunit-like  25.97 
 
 
368 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0233772  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1367  ribulose bisophosphate carboxylase  26.23 
 
 
472 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1327  ribulose bisophosphate carboxylase  27.81 
 
 
523 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180974  normal  0.453958 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1699  ribulose bisophosphate carboxylase  27.06 
 
 
487 aa  87  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118082  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0333  ribulose bisophosphate carboxylase  28.7 
 
 
492 aa  87  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1602  ribulose bisophosphate carboxylase  25.39 
 
 
472 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1628  ribulose bisophosphate carboxylase  25.39 
 
 
472 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1282  ribulose bisophosphate carboxylase  25.81 
 
 
486 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2941  ribulose bisophosphate carboxylase  25.81 
 
 
486 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4049  ribulose bisophosphate carboxylase  27.16 
 
 
488 aa  86.3  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3032  ribulose bisophosphate carboxylase  28.38 
 
 
488 aa  86.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>