172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A1801 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A1801  RNA polymerase sigma factor SigW  100 
 
 
112 aa  220  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.362115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1912  RNA polymerase sigma factor SigW  99.11 
 
 
160 aa  219  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1655  RNA polymerase sigma factor SigW  98.21 
 
 
181 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.124423  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1605  RNA polymerase sigma factor SigW  98.21 
 
 
160 aa  217  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1658  RNA polymerase sigma factor SigW  98.21 
 
 
160 aa  216  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1636  RNA polymerase sigma factor SigW  98.21 
 
 
160 aa  216  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000576996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1789  RNA polymerase sigma factor SigW  98.21 
 
 
160 aa  216  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1838  RNA polymerase sigma factor SigW  98.21 
 
 
160 aa  216  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3540  RNA polymerase sigma factor SigW  96.43 
 
 
160 aa  215  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1861  RNA polymerase sigma factor SigW  96.43 
 
 
160 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248092  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2150  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.53 
 
 
198 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1647  sigma-24 (FecI-like)  29.9 
 
 
541 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1195  RNA polymerase sigma-24 factor  34.86 
 
 
208 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.336736  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0756  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.63 
 
 
182 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0339  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  41.82 
 
 
247 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.162466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5744  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.52 
 
 
195 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.893237  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4129  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.37 
 
 
208 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2458  RNA polymerase sigma factor  36.36 
 
 
245 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0973834  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2697  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.77 
 
 
226 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0605  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.17 
 
 
202 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000948588 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0065  RNA polymerase sigma factor RpoE  27.03 
 
 
193 aa  48.9  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3068  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.77 
 
 
211 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1471  RNA polymerase sigma factor RpoE  33.33 
 
 
192 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2267  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.91 
 
 
196 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0916495  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3077  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.19 
 
 
191 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0022477  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1198  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.19 
 
 
191 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000152256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2791  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.13 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00850329  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3676  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.19 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.408035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1062  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.13 
 
 
191 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000160674  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3060  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.19 
 
 
191 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.26324  hitchhiker  0.000187341 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0154  RNA polymerase sigma factor SigW  34.86 
 
 
183 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000564665  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2126  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.91 
 
 
192 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal  0.031897 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02467  RNA polymerase, sigma 24 (sigma E) factor  30.19 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1095  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.19 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.066922  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2966  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.19 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2750  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.19 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.405161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3810  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.19 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0374939  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2832  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.19 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02431  hypothetical protein  30.19 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0867  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.03 
 
 
198 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2728  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.19 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.134182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2859  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.19 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0265071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1104  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.19 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.451168  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2726  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.19 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11882  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2938  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.19 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.497445  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2854  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.19 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.249889 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2850  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.19 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.718935  normal  0.190623 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3118  RNA polymerase sigma factor RpoE  32.41 
 
 
192 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239779  normal  0.0316292 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1195  RNA polymerase sigma factor RpoE  32.41 
 
 
192 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1239  RNA polymerase sigma factor RpoE  32.41 
 
 
192 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00674389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1272  RNA polymerase sigma factor RpoE  32.41 
 
 
192 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178396  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2178  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.91 
 
 
196 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.103382  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4352  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  33.64 
 
 
169 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00101524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2628  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.04 
 
 
185 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3643  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.77 
 
 
211 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.145973  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3697  sigma-70 family RNA polymerase sigma factor  32.63 
 
 
201 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1129  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.19 
 
 
191 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0822674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3604  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.19 
 
 
191 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0116592  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0156  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  33.33 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1182  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.19 
 
 
191 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0314169  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0909  RNA polymerase sigma factor  39.39 
 
 
275 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.182648 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4747  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily  33.64 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000130833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1678  sigma-24 (FecI-like)  28.97 
 
 
218 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1115  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.48 
 
 
208 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.37407  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1394  RNA polymerase sigma-E factor  31.48 
 
 
208 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1153  RNA polymerase sigma factor RpoE  32.41 
 
 
192 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000609864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1375  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.41 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.427814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4446  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  32.71 
 
 
169 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4736  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily  33.64 
 
 
169 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1427  RNA polymerase sigma factor AlgU  27.78 
 
 
193 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0770858  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1342  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.48 
 
 
192 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1362  RNA polymerase sigma factor AlgU  27.78 
 
 
193 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00625661  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1150  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.69 
 
 
223 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.188745  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2854  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.48 
 
 
192 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0729603  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2936  RNA polymerase sigma factor RpoE  30.56 
 
 
192 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0097263  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3032  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.48 
 
 
192 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0207774  normal  0.587259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4294  RNA polymerase sigma factor AlgU  27.78 
 
 
193 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.55493  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4380  RNA polymerase sigma factor AlgU  27.78 
 
 
193 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1067  RNA polymerase sigma factor AlgU  27.78 
 
 
193 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0360661  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03970  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.73 
 
 
195 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000171758  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0179  RNA polymerase sigma factor RpoE  31.19 
 
 
199 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2423  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.43 
 
 
194 aa  44.7  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0213  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily  33.33 
 
 
164 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54430  RNA polymerase sigma factor AlgU  27.78 
 
 
193 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000031272  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4757  RNA polymerase sigma factor AlgU  27.78 
 
 
193 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0171  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  32.35 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0162  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  32.35 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0169  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  32.35 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0375  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.82 
 
 
189 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0191  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily  32.35 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1784  RNA polymerase sigma factor  33.33 
 
 
244 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.181738  normal  0.484528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1790  RNA polymerase sigma factor  38.71 
 
 
205 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.908716  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2356  RNA polymerase sigma-70 factor  33.65 
 
 
200 aa  43.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240028  normal  0.522752 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07866  RNA polymerase ECF-type sigma factor  39.66 
 
 
191 aa  43.9  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0756  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.9 
 
 
204 aa  43.5  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1746  RNA polymerase sigma factor RpoE  27.78 
 
 
200 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.30228  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0843  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.14 
 
 
223 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000467073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6397  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.33 
 
 
191 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.48817  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5003  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.36 
 
 
209 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2531  RNA polymerase sigma factor RpoE  28.7 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>