46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_3856 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_3856  16S rRNA processing protein RimM  100 
 
 
68 aa  140  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.26975e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3884  16S rRNA-processing protein RimM  96.97 
 
 
171 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000398495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3890  16S rRNA-processing protein RimM  96.97 
 
 
171 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3583  16S rRNA-processing protein RimM  96.97 
 
 
171 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.00886e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3693  16S rRNA-processing protein RimM  96.97 
 
 
171 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000284682  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3980  16S rRNA-processing protein RimM  96.97 
 
 
171 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000074804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3601  16S rRNA-processing protein RimM  95.45 
 
 
171 aa  134  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000401419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3941  16S rRNA-processing protein RimM  86.36 
 
 
171 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000195727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2494  16S rRNA-processing protein RimM  84.85 
 
 
171 aa  124  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000966692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1302  16S rRNA-processing protein RimM  84.85 
 
 
171 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000535622  unclonable  1.06066e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3665  16S rRNA-processing protein RimM  80.88 
 
 
171 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000001599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1091  16S rRNA-processing protein RimM  71.21 
 
 
172 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000655231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1984  16S rRNA-processing protein RimM  66.67 
 
 
172 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1152  16S rRNA-processing protein RimM  59.02 
 
 
168 aa  80.1  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355761  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1355  16S rRNA-processing protein RimM  52.31 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000868178  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1384  16S rRNA-processing protein RimM  47.62 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00157124  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1479  16S rRNA-processing protein RimM  45 
 
 
173 aa  62.4  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1355  16S rRNA processing protein RimM  42.19 
 
 
177 aa  58.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000116768  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0787  16S rRNA-processing protein RimM  43.94 
 
 
173 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.0056e-16  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1659  16S rRNA-processing protein RimM  39.68 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0130  16S rRNA-processing protein RimM  41.07 
 
 
177 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0512614  normal  0.0110832 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1298  16S rRNA-processing protein RimM  43.33 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1323  16S rRNA-processing protein RimM  43.33 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000721778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0767  16S rRNA-processing protein RimM  41.27 
 
 
174 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000495507  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0969  16S rRNA processing protein RimM  42.19 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000035902  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26021  16S rRNA-processing protein RimM  37.5 
 
 
181 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0664  16S rRNA-processing protein RimM  49.09 
 
 
170 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.377331  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0805  16S rRNA-processing protein RimM  41.67 
 
 
167 aa  47  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000311839  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0800  16S rRNA processing protein RimM  36.07 
 
 
166 aa  47  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0383963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1371  16S rRNA processing protein RimM  42.62 
 
 
179 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000034435  normal  0.381877 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1091  16S rRNA-processing protein RimM  37.5 
 
 
233 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166922  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0164  16S rRNA processing protein RimM  36.21 
 
 
217 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0176  16S rRNA-processing protein RimM  37.29 
 
 
180 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2085  16S rRNA processing protein RimM  40 
 
 
172 aa  43.5  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4627  16S rRNA-processing protein RimM  36.21 
 
 
208 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2052  16S rRNA processing protein RimM  53.57 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163547  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09770  16S rRNA processing protein RimM  38.89 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.098871  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0712  16S rRNA-processing protein RimM  38.46 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2189  16S rRNA-processing protein RimM  42.59 
 
 
172 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0264003  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4117  16S rRNA-processing protein RimM  48.48 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4078  16S rRNA-processing protein RimM  48.48 
 
 
186 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2259  16S rRNA-processing protein RimM  33.33 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.133781  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0226  16S rRNA processing protein RimM  36.36 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5924  16S rRNA processing protein RimM  32.73 
 
 
172 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.144619  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1386  16S rRNA-processing protein RimM  53.33 
 
 
207 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0981  16S rRNA processing protein RimM  35 
 
 
171 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613857  normal  0.277259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>