279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A5291 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5245  RNA polymerase factor sigma-54  99.08 
 
 
435 aa  888    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4992  RNA polymerase factor sigma-54  98.85 
 
 
435 aa  887    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4821  RNA polymerase factor sigma-54  99.54 
 
 
435 aa  890    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4831  RNA polymerase factor sigma-54  99.08 
 
 
435 aa  887    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5291  RNA polymerase factor sigma-54  100 
 
 
435 aa  894    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5256  RNA polymerase factor sigma-54  97.47 
 
 
435 aa  848    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.584318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5372  RNA polymerase factor sigma-54  98.85 
 
 
435 aa  887    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5696  RNA polymerase factor sigma-54  96.32 
 
 
435 aa  840    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4934  RNA polymerase factor sigma-54  93.79 
 
 
454 aa  819    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5227  RNA polymerase factor sigma-54  99.08 
 
 
435 aa  887    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3685  RNA polymerase factor sigma-54  86.67 
 
 
435 aa  764    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2965  RNA polymerase factor sigma-54  44.85 
 
 
437 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000225777  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3140  RNA polymerase factor sigma-54  43.22 
 
 
435 aa  348  9e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2992  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  35.39 
 
 
470 aa  292  7e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2020  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  37.53 
 
 
479 aa  290  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1618  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  37.25 
 
 
453 aa  285  8e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3334  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  41.36 
 
 
510 aa  283  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0355  RNA polymerase factor sigma-54  33.81 
 
 
493 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3938  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  34.12 
 
 
472 aa  279  6e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000403843  normal  0.477567 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1938  RNA polymerase, sigma 54/sigma 60 factor  33.97 
 
 
485 aa  279  9e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1303  RNA polymerase factor sigma-54  35.89 
 
 
461 aa  275  9e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357078  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0265  sigma-54 (RpoN)  36.59 
 
 
461 aa  275  9e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1771  sigma-54 factor  33.62 
 
 
474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0786495  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0952  RNA polymerase factor sigma-54  33 
 
 
497 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0991  RNA polymerase factor sigma-54  33 
 
 
497 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3512  RNA polymerase factor sigma-54  32.78 
 
 
477 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3679  RNA polymerase factor sigma-54  32.78 
 
 
477 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.246915 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3510  RNA polymerase factor sigma-54  32.78 
 
 
477 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3581  RNA polymerase factor sigma-54  32.78 
 
 
477 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3617  RNA polymerase factor sigma-54  32.78 
 
 
477 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.167296 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1505  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  32.76 
 
 
476 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.132062  hitchhiker  0.000751094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0870  RNA polymerase factor sigma-54  33.2 
 
 
497 aa  273  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252205  normal  0.87298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2755  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  34.23 
 
 
494 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378984  normal  0.0333913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2166  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  33.62 
 
 
482 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1514  RNA polymerase factor sigma-54  33 
 
 
513 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0597  RNA polymerase factor sigma-54  33 
 
 
502 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.779758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3108  RNA polymerase factor sigma-54  33 
 
 
502 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2942  RNA polymerase factor sigma-54  33 
 
 
502 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0765  RNA polymerase factor sigma-54  33 
 
 
513 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.823391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0581  RNA polymerase factor sigma-54  33 
 
 
502 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0486  RNA polymerase factor sigma-54  32.6 
 
 
513 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57940  RNA polymerase factor sigma-54  33 
 
 
497 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0076  RNA polymerase factor sigma-54  33 
 
 
513 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4263  RNA polymerase factor sigma-54  32.6 
 
 
497 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1887  RNA polymerase sigma-54 factor  32.62 
 
 
481 aa  270  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03067  DNA-directed RNA polymerase subunit N  32.35 
 
 
477 aa  270  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0010606  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3568  RNA polymerase factor sigma-54  32.35 
 
 
477 aa  270  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0498  RNA polymerase factor sigma-54  32.35 
 
 
477 aa  270  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.128471  normal  0.323836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4524  RNA polymerase factor sigma-54  32.35 
 
 
477 aa  270  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3395  RNA polymerase factor sigma-54  32.35 
 
 
477 aa  270  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03018  hypothetical protein  32.35 
 
 
477 aa  270  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0014618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3498  RNA polymerase factor sigma-54  32.35 
 
 
477 aa  270  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3690  RNA polymerase factor sigma-54  32.35 
 
 
477 aa  270  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0505  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  32.35 
 
 
477 aa  269  7e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0959  RNA polymerase factor sigma-54  38.06 
 
 
489 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.742347  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0303  RNA polymerase factor sigma-54  39.66 
 
 
492 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152498  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0506  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  33.12 
 
 
480 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.670024  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1513  RNA polymerase factor sigma-54  35.23 
 
 
461 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1601  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  34.92 
 
 
474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.62613 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0261  sigma-54 (RpoN)  36.06 
 
 
461 aa  266  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2069  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  39.44 
 
 
488 aa  266  5.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349645  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0084  sigma-54 (RpoN)  32.58 
 
 
488 aa  266  7e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4453  RNA polymerase sigma-54 factor  32.19 
 
 
497 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0857  RNA polymerase factor sigma-54  31.39 
 
 
497 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.718619  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2709  RNA polymerase factor sigma-54  37.95 
 
 
501 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0191424 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2851  RNA polymerase factor sigma-54  37.95 
 
 
501 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795188  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0408  RNA polymerase factor sigma-54  38.83 
 
 
499 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.236863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4719  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  35.71 
 
 
467 aa  264  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00408234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4147  RNA polymerase factor sigma-54  32.19 
 
 
511 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2793  sigma-54, RpoN  34.37 
 
 
482 aa  263  6e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0281  RNA polymerase factor sigma-54  32.21 
 
 
477 aa  262  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4167  sigma-54 (RpoN)  33.74 
 
 
501 aa  262  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0610813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2802  RNA polymerase factor sigma-54  37.67 
 
 
501 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.402108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2177  RNA polymerase factor sigma-54  37.67 
 
 
498 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2791  RNA polymerase factor sigma-54  37.67 
 
 
498 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148981  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4122  RNA polymerase factor sigma-54  38.23 
 
 
505 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5035  RNA polymerase factor sigma-54  33.4 
 
 
497 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6121  RNA polymerase factor sigma-54  37.4 
 
 
501 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2972  RNA polymerase, sigma-54 subunit, RpoN  32.62 
 
 
481 aa  260  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000649238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0974  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  36.93 
 
 
479 aa  260  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1283  sigma-54 (RpoN)  32.69 
 
 
483 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000990086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0274  RNA polymerase factor sigma-54  32.14 
 
 
477 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0721448  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0596  RNA polymerase factor sigma-54  37.67 
 
 
503 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0209881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15850  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  35.27 
 
 
436 aa  259  7e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4298  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  33.33 
 
 
501 aa  259  9e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3638  RNA polymerase factor sigma-54  30.61 
 
 
477 aa  259  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4320  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  33.13 
 
 
501 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.757017  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0150  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  33.41 
 
 
475 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125748  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3179  RNA polymerase factor sigma-54  31.12 
 
 
507 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0326  RNA polymerase factor sigma-54  36.57 
 
 
505 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35647  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3390  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  32.67 
 
 
515 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0263  RNA polymerase factor sigma-54  38.55 
 
 
503 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0524  RNA polymerase factor sigma-54  37.12 
 
 
501 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03193  RNA polymerase sigma-54 factor  31.85 
 
 
493 aa  256  6e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02740  RNA polymerase  36.27 
 
 
484 aa  256  7e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0329899  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0708  RNA polymerase factor sigma-54  32.72 
 
 
484 aa  256  7e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.725065  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0290  RNA polymerase factor sigma-54  38.27 
 
 
503 aa  255  9e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3657  RNA polymerase factor sigma-54  32.15 
 
 
478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0558274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0427  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  31.76 
 
 
477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00518389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3025  RNA polymerase sigma-54 factor  32.02 
 
 
475 aa  253  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>