More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3826 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  100 
 
 		 343 aa  291  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3826  recA protein, group I intron-containing  100 
 
 		 141 aa  290  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  98.57 
 
 		 343 aa  287  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3791  recA protein, group I intron-containing  98.58 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000289206 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3538  recA protein (recombinase A), C-terminal region  98.58 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000279378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  97.86 
 
 		 343 aa  254  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3520  recA protein (recombinase A), C-terminal region  97.87 
 
 		 141 aa  250  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000187818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  94.29 
 
 		 343 aa  244  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  93.57 
 
 		 343 aa  241  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  89.29 
 
 		 343 aa  234  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2083  recA protein  78.79 
 
 		 277 aa  222  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1190  recA protein  81.25 
 
 		 283 aa  221  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000832265  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  71.83 
 
 		 347 aa  203  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  71.83 
 
 		 347 aa  203  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  75.81 
 
 		 349 aa  199  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  69.42 
 
 		 355 aa  191  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  67.2 
 
 		 341 aa  189  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  66.4 
 
 		 347 aa  184  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  63.04 
 
 		 364 aa  184  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  66.94 
 
 		 362 aa  182  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  66.17 
 
 		 348 aa  182  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  65.32 
 
 		 347 aa  180  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  63.85 
 
 		 385 aa  180  8.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1920  recA protein  65.08 
 
 		 347 aa  176  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000130185  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  63.24 
 
 		 364 aa  175  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  67.23 
 
 		 343 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  60.87 
 
 		 376 aa  172  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  65.32 
 
 		 352 aa  172  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  59.12 
 
 		 365 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  58.73 
 
 		 341 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  59.42 
 
 		 357 aa  170  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  62.1 
 
 		 352 aa  170  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  60.48 
 
 		 361 aa  169  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2960  recombinase A  64.46 
 
 		 353 aa  169  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0334216  hitchhiker  0.0000660744 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  62.1 
 
 		 352 aa  169  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  62.9 
 
 		 345 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  64.04 
 
 		 344 aa  168  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  57.78 
 
 		 350 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  63.71 
 
 		 364 aa  167  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  61.6 
 
 		 347 aa  168  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  60.16 
 
 		 363 aa  168  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3118  recombinase A  57.86 
 
 		 353 aa  168  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163831  unclonable  0.0000179844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  64.91 
 
 		 336 aa  167  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  59.23 
 
 		 367 aa  167  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  61.07 
 
 		 379 aa  167  6e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  60.48 
 
 		 363 aa  166  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  64.04 
 
 		 338 aa  166  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  68.85 
 
 		 349 aa  166  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  64.04 
 
 		 338 aa  166  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  57.97 
 
 		 351 aa  166  9e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  57.81 
 
 		 362 aa  166  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  59.68 
 
 		 366 aa  166  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  59.68 
 
 		 364 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  61.29 
 
 		 350 aa  166  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  57.14 
 
 		 347 aa  165  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  55.07 
 
 		 347 aa  165  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  62.4 
 
 		 361 aa  165  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  60 
 
 		 345 aa  165  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2236  recA protein  66.67 
 
 		 347 aa  165  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  64.91 
 
 		 368 aa  165  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  58.4 
 
 		 358 aa  165  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  58.68 
 
 		 335 aa  165  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  57.89 
 
 		 347 aa  165  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  56.69 
 
 		 364 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  56.69 
 
 		 362 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  60.48 
 
 		 378 aa  165  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  60.48 
 
 		 346 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  72.27 
 
 		 346 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  55.97 
 
 		 356 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  61.6 
 
 		 352 aa  164  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  58.87 
 
 		 363 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  59.68 
 
 		 363 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  58.91 
 
 		 343 aa  164  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  57.58 
 
 		 356 aa  164  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  60.48 
 
 		 350 aa  164  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  56.8 
 
 		 358 aa  164  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  57.25 
 
 		 345 aa  164  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  55.15 
 
 		 352 aa  164  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  58.06 
 
 		 362 aa  164  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  59.06 
 
 		 357 aa  164  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  59.68 
 
 		 377 aa  164  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  58.4 
 
 		 358 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  55.71 
 
 		 357 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  56.69 
 
 		 359 aa  163  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  54.01 
 
 		 361 aa  163  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  57.26 
 
 		 362 aa  163  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  56.52 
 
 		 350 aa  163  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  62.18 
 
 		 358 aa  162  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  53.57 
 
 		 347 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  55.15 
 
 		 384 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  57.48 
 
 		 343 aa  162  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  52.86 
 
 		 358 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  60 
 
 		 347 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  54.68 
 
 		 355 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  58.87 
 
 		 383 aa  162  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  60.48 
 
 		 365 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  52.94 
 
 		 379 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  64.04 
 
 		 348 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  64.04 
 
 		 348 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  58.87 
 
 		 350 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>