More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3216 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3216  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 
331 aa  664    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.990637  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0626  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  63.04 
 
 
313 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.833097  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4965  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  69.47 
 
 
313 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.111268  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4445  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  69.47 
 
 
313 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000956374 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5320  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  68.53 
 
 
315 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0413  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  66.78 
 
 
312 aa  389  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000162891  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3330  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  69.47 
 
 
313 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.740967  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5247  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  69.47 
 
 
313 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5037  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  69.47 
 
 
313 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.680261  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3601  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  68.77 
 
 
313 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0339388  normal  0.918722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1086  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  64.91 
 
 
313 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.199216 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5595  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  65.26 
 
 
313 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3131  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  67.02 
 
 
314 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00793964  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4172  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  65.26 
 
 
312 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333211 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1348  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  64.21 
 
 
313 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.567327  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3102  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  61.75 
 
 
326 aa  368  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.75738  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02650  D-ribose-binding periplasmic protein  39.81 
 
 
357 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02611  hypothetical protein  39.81 
 
 
316 aa  211  9e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09540  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.87 
 
 
320 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0566218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2012  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.74 
 
 
356 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2490  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.28 
 
 
340 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3320  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.68 
 
 
311 aa  152  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1853  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.74 
 
 
339 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5133  ABC transporter substrate binding protein (ribose)  34.26 
 
 
313 aa  149  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2251  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.19 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0157  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  31.96 
 
 
329 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000000969227  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3001  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 
343 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3227  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.56 
 
 
329 aa  135  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0151  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.58 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00856305  normal  0.0288368 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6313  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.14 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.330305 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6472  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.14 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.555546  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6707  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.14 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2634  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6343  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.44 
 
 
319 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0293175  normal  0.309769 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2603  twin-arginine translocation pathway signal  31.54 
 
 
338 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.912871  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1226  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.45 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1252  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.45 
 
 
315 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2264  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.75 
 
 
345 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000366985  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3345  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.14 
 
 
313 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.341454  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5473  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.41 
 
 
315 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433436  normal  0.94425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1272  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.48 
 
 
330 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.269718  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5339  ABC transporter substrate binding protein (ribose)  30.92 
 
 
329 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0039  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.79 
 
 
320 aa  126  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1132  putative solute-binding component of ABC transporter  30.27 
 
 
334 aa  126  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0041819  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3294  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.71 
 
 
318 aa  126  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0273  RbsB protein  28.14 
 
 
364 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3307  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.74 
 
 
337 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0871  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.12 
 
 
314 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1401  ribose ABC transporter, substrate binding protein  31.97 
 
 
315 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3158  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.32 
 
 
337 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2009  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.17 
 
 
325 aa  122  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.51 
 
 
310 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0377359  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3541  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.99 
 
 
313 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1600  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.67 
 
 
342 aa  119  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0114  ribose ABC transporter, periplasmic D-ribose-binding protein  28.31 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.686148  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3044  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.34 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2902  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.64 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1336  periplasmic binding protein and sugar binding domain of the LacI family protein  31.15 
 
 
312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.454554 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0166  monosaccharide-transporting ATPase  28.47 
 
 
307 aa  116  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7477  sugar ABC transporter  27.24 
 
 
345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.83 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.57 
 
 
315 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1618  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.69 
 
 
316 aa  107  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2985  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.94 
 
 
336 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126254  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0767  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.44 
 
 
312 aa  106  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000173406  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2854  putative secreted solute-binding lipoprotein  31.76 
 
 
324 aa  106  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0612  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.24 
 
 
326 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.81 
 
 
321 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.455143  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2906  Monosaccharide-transporting ATPase  25.95 
 
 
308 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0655902 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0438  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.69 
 
 
331 aa  102  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.681459  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  27.03 
 
 
352 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3328  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.43 
 
 
311 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3621  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.95 
 
 
329 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0048  putative D-ribose-binding periplasmic protein  27.08 
 
 
314 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1365  ribose ABC transporter, periplasmic binding protein  30.88 
 
 
312 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.64 
 
 
308 aa  99.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0934818  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4136  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.72 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1643  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.18 
 
 
338 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00121645  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0833  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.37 
 
 
323 aa  98.2  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0810  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.37 
 
 
323 aa  98.2  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.869205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6094  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.32 
 
 
323 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01070  monosaccharide-binding protein  26.63 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3971  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.56 
 
 
350 aa  97.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.182523  normal  0.0264597 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1798  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.57 
 
 
324 aa  97.4  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482327  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0393  sugar ABC transporter (sugar-binding protein)  28.13 
 
 
321 aa  97.1  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0343  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.49 
 
 
319 aa  96.3  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158898  normal  0.129182 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03960  D-allose transporter subunit  30 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3903  Monosaccharide-transporting ATPase  30 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3938  D-allose transporter subunit  30 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0923  monosaccharide-transporting ATPase  28.34 
 
 
289 aa  95.5  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03920  hypothetical protein  30 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4898  D-ribose transporter subunit RbsB  25.79 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00612951  hitchhiker  0.000000869292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2119  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  29.3 
 
 
341 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3087  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.28 
 
 
343 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154884  normal  0.401469 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4759  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.28 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125335  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1871  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.17 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4554  D-allose transporter subunit  29.62 
 
 
313 aa  94  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0686  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4654  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.28 
 
 
313 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.995284  normal  0.589042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1681  putative secreted solute-binding lipoprotein  28.79 
 
 
344 aa  92.4  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156663  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3419  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.49 
 
 
302 aa  92.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172259  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>