More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A0831 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A0831  amino-acid permease RocC  100 
 
 		 297 aa  597  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  97.64 
 
 		 471 aa  588  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  97.31 
 
 		 471 aa  584  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  97.6 
 
 		 468 aa  577  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  91.58 
 
 		 472 aa  559  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  61.87 
 
 		 473 aa  388  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  63.51 
 
 		 470 aa  387  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  61.54 
 
 		 473 aa  387  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  61.87 
 
 		 473 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  61.54 
 
 		 473 aa  387  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  62.54 
 
 		 473 aa  387  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  61.54 
 
 		 473 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  61.87 
 
 		 473 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  61.2 
 
 		 473 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  61.54 
 
 		 473 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2996  amino acid permease family protein  59.87 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.65935e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2786  amino acid permease family protein  59.53 
 
 		 478 aa  377  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000595058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  59.87 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  58.39 
 
 		 472 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  60.14 
 
 		 513 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2716  amino acid permease; arginine permease  58.53 
 
 		 474 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000134476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2998  amino acid permease family protein  59.53 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000337351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2325  amino acid permease-associated region  60.27 
 
 		 476 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000716314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  60.78 
 
 		 474 aa  374  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  60.14 
 
 		 474 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  61.13 
 
 		 474 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  61.13 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  61.94 
 
 		 473 aa  358  6e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  58.72 
 
 		 476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  61.57 
 
 		 475 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  61.57 
 
 		 475 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  61.57 
 
 		 475 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  61.57 
 
 		 475 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  61.57 
 
 		 473 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  61.57 
 
 		 475 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  61.34 
 
 		 473 aa  354  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5465  amino acid permease-associated region  56.61 
 
 		 469 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  hitchhiker  0.00900636 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  55.32 
 
 		 469 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  51.59 
 
 		 470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65850  amino acid ABC transporter permease  51.59 
 
 		 470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  50.89 
 
 		 468 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  52.04 
 
 		 468 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  49.82 
 
 		 470 aa  299  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  52.04 
 
 		 468 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3559  amino acid permease-associated region  51.24 
 
 		 485 aa  298  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0827  S-methylmethionine transporter  52.42 
 
 		 474 aa  295  5e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1041  amino acid permease-associated region  48.07 
 
 		 467 aa  293  2e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000184403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3345  amino acid permease-associated region  50.9 
 
 		 475 aa  292  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2927  S-methylmethionine transporter  47.1 
 
 		 470 aa  292  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1143  amino acid permease-associated region  48.24 
 
 		 477 aa  285  5.999999999999999e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00088107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0660  amino acid transporter  49.29 
 
 		 479 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0694  amino acid permease-associated region  49.29 
 
 		 479 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144358 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1306  amino acid permease  50.71 
 
 		 458 aa  282  5.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000234157  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  50.53 
 
 		 458 aa  282  5.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01794  S-methylmethionine transporter  47.14 
 
 		 465 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0507  amino acid transporter  47.29 
 
 		 524 aa  266  2e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.229334  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0325  amino acid permease-associated region  44.96 
 
 		 462 aa  260  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  42.6 
 
 		 466 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  40.39 
 
 		 489 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  38.82 
 
 		 488 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  41.53 
 
 		 489 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  41.53 
 
 		 489 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  41.53 
 
 		 489 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  41.53 
 
 		 489 aa  218  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  41.53 
 
 		 489 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  40.07 
 
 		 489 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  39.03 
 
 		 520 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  39.03 
 
 		 520 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  39.03 
 
 		 520 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  39.03 
 
 		 520 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  39.03 
 
 		 520 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  39.03 
 
 		 520 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  37.17 
 
 		 488 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  37.17 
 
 		 488 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  37.17 
 
 		 488 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  37.17 
 
 		 488 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  37.17 
 
 		 488 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  37.17 
 
 		 488 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  37.17 
 
 		 488 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  40.2 
 
 		 489 aa  216  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  37.17 
 
 		 488 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  39.03 
 
 		 520 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  40.86 
 
 		 489 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  40.86 
 
 		 489 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  40.86 
 
 		 489 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  40.86 
 
 		 489 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  40.86 
 
 		 489 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126674 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2752  lysine transporter  39.33 
 
 		 503 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970075  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2670  lysine transporter  39.33 
 
 		 503 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  39.33 
 
 		 503 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  40.86 
 
 		 489 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  40.86 
 
 		 489 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  40.86 
 
 		 489 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2418  lysine transporter  39.93 
 
 		 490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  40.86 
 
 		 489 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  38.76 
 
 		 512 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  39.09 
 
 		 493 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  38.41 
 
 		 490 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  36.18 
 
 		 488 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  36.51 
 
 		 488 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>