More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6153 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6153  putative sugar (D-ribose) ABC transporter (permease protein)  100 
 
 
341 aa  671    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0302117 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4601  Monosaccharide-transporting ATPase  67.57 
 
 
341 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.841849 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6207  inner-membrane translocator  66.97 
 
 
341 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.729739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1965  inner-membrane translocator  66.97 
 
 
341 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.389843  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0780  inner-membrane translocator  46.46 
 
 
328 aa  268  8.999999999999999e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  39.03 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  39.16 
 
 
322 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  39.55 
 
 
322 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  39.38 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  38.39 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  37.74 
 
 
324 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  40.73 
 
 
321 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  39.38 
 
 
324 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  37.42 
 
 
327 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  39.48 
 
 
321 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  39.48 
 
 
321 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  39.48 
 
 
321 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  39.48 
 
 
321 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  39.48 
 
 
321 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  39.23 
 
 
321 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  39.23 
 
 
321 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  39.23 
 
 
321 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  39.23 
 
 
321 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  39.23 
 
 
321 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  37.1 
 
 
327 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  39.23 
 
 
321 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  39.23 
 
 
321 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  39.23 
 
 
321 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  39.81 
 
 
321 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  34.97 
 
 
346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  35.85 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  36.31 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  37.89 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  37.89 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  36.59 
 
 
331 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.99 
 
 
311 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  35.99 
 
 
323 aa  162  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  37.59 
 
 
317 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 
311 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 
311 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  37.59 
 
 
317 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 
311 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.99 
 
 
311 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  36.73 
 
 
334 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 
311 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.67 
 
 
311 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  36.61 
 
 
309 aa  159  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.35 
 
 
311 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  38.23 
 
 
336 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.35 
 
 
311 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.03 
 
 
311 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.03 
 
 
311 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.94 
 
 
310 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  38.61 
 
 
310 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  35.35 
 
 
310 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  37.94 
 
 
835 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  35.99 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  35.62 
 
 
343 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  35.62 
 
 
343 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  33.65 
 
 
341 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.79 
 
 
334 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  36.79 
 
 
334 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4865  inner-membrane translocator  37.04 
 
 
333 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  33.13 
 
 
335 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.13 
 
 
336 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  33.12 
 
 
314 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3674  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.94 
 
 
337 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765342  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  37.3 
 
 
306 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  37.16 
 
 
334 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  36.21 
 
 
338 aa  149  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  36.43 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  35.67 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  32.59 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  33.76 
 
 
360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  35.69 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  33.89 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  32.17 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  35.18 
 
 
314 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 
331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  35.76 
 
 
342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  34.82 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  35.76 
 
 
342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  33.87 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  37.25 
 
 
324 aa  146  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2243  monosaccharide-transporting ATPase  36.01 
 
 
337 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163758  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  35.76 
 
 
334 aa  146  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  35.62 
 
 
337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0963  Monosaccharide-transporting ATPase  37.2 
 
 
337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  35.64 
 
 
330 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  35.64 
 
 
330 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  35.86 
 
 
322 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  30.84 
 
 
345 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 
330 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  33.64 
 
 
314 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  38.02 
 
 
325 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  35.02 
 
 
348 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 
363 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  35.09 
 
 
318 aa  144  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  35.69 
 
 
313 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 
328 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>