16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5949 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5949  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  413  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1584  hypothetical protein  43.48 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5007  hypothetical protein  37.93 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.536268  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5311  hypothetical protein  38.29 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1852  hypothetical protein  34.76 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2187  hypothetical protein  34.76 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0250  hypothetical protein  55.93 
 
 		 127 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66839  normal  0.167361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1803  hypothetical protein  34.78 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0310445  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2588  hypothetical protein  31.91 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0024  hypothetical protein  30.77 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1246  hypothetical protein  31.91 
 
 		 197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1935  hypothetical protein  31.09 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2715  hypothetical protein  34.81 
 
 		 212 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0031  hypothetical protein  33.14 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0472  hypothetical protein  30.88 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3947  hypothetical protein  27.84 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0213585  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>