11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5802 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5802  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  400  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.749179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0661  hypothetical protein  34.69 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0568  hypothetical protein  34.72 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00869432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4240  hypothetical protein  35.66 
 
 		 199 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1340  hypothetical protein  35.56 
 
 		 203 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.431234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4918  hypothetical protein  30.81 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4090  hypothetical protein  34.06 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1200  hypothetical protein  30.38 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3614  hypothetical protein  32.17 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0507032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3421  hypothetical protein  31.65 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00392236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3730  hypothetical protein  31.65 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.342678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>