12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5424 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5424  hypothetical protein  100 
 
 		 567 aa  1113    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1886  peptidase  30.05 
 
 		 827 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1300  peptidase C2 calpain  33.54 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0117  peptidase C2 calpain  27.71 
 
 		 598 aa  68.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3448  peptidase C2 calpain  30.43 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0447153  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4450  peptidase C2, calpain  25.17 
 
 		 279 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16523  predicted protein  27.27 
 
 		 823 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0619  hypothetical protein  27.01 
 
 		 393 aa  51.2  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2853  peptidase C2 calpain  32.99 
 
 		 361 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0973219  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03130  hypothetical protein  34.02 
 
 		 277 aa  48.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00256  Calpain-like protease palB (EC 3.4.22.-)(Cysteine protease palB) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00204]  22.36 
 
 		 847 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0894791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0483  hypothetical protein  28.93 
 
 		 3754 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.38288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>