38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3679 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3679  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  590  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0091  hypothetical protein  36.51 
 
 
303 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000240765  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1449  hypothetical protein  34.52 
 
 
303 aa  155  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0998  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0996  hypothetical protein  35.78 
 
 
284 aa  59.3  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.228151 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  28.42 
 
 
302 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  30.4 
 
 
267 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1904  hypothetical protein  31.52 
 
 
460 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1682  hydrolase  31.52 
 
 
460 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.35711  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  24.05 
 
 
436 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1730  hypothetical protein  31.33 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1866  hypothetical protein  31.33 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  30.4 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  29.6 
 
 
267 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  29.6 
 
 
267 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  29.6 
 
 
272 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1708  hydrolase  31.52 
 
 
460 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  29.6 
 
 
267 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  29.6 
 
 
267 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  24.39 
 
 
517 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  29.6 
 
 
277 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  24.29 
 
 
512 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.63 
 
 
412 aa  49.7  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1982  hypothetical protein  30.67 
 
 
460 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.900389  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.63 
 
 
412 aa  49.7  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  23.58 
 
 
512 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1953  hypothetical protein  31.48 
 
 
460 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0994  hypothetical protein  30.86 
 
 
460 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  28.8 
 
 
267 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  28 
 
 
267 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  23.58 
 
 
512 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  31.21 
 
 
460 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4315  hypothetical protein  30.57 
 
 
460 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 
263 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
302 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1293  hypothetical protein  21.57 
 
 
279 aa  42.7  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  31.21 
 
 
498 aa  42.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>