15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3041 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3041  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  610  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2056  hypothetical protein  41.07 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2628  hypothetical protein  37.12 
 
 		 305 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.460391  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1939  hypothetical protein  40.74 
 
 		 302 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0577581  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2228  hypothetical protein  33.72 
 
 		 274 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00178512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3520  hypothetical protein  46.99 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1773  hypothetical protein  53.4 
 
 		 334 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185989  decreased coverage  0.00548408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5904  hypothetical protein  36.99 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188041  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3299  hypothetical protein  43.33 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3622  hypothetical protein  43.33 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.453951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4496  hypothetical protein  48.65 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1645  hypothetical protein  41.94 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3499  hypothetical protein  28.99 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.449535 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  22.73 
 
 		 1888 aa  44.3  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5306  hypothetical protein  41.46 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0325155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>