More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1512 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1512  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  100 
 
 		 110 aa  228  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.752891  normal  0.232185 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  62.73 
 
 		 1301 aa  155  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  64.55 
 
 		 474 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  61.47 
 
 		 771 aa  148  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1507  putative PAS/PAC sensor protein  60.55 
 
 		 357 aa  147  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000751678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  63.46 
 
 		 480 aa  144  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  56.48 
 
 		 492 aa  144  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  57.8 
 
 		 848 aa  140  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  58.18 
 
 		 453 aa  140  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  55.05 
 
 		 389 aa  139  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  57.84 
 
 		 405 aa  138  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  55.45 
 
 		 384 aa  138  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  58.25 
 
 		 341 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  55.45 
 
 		 334 aa  137  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  58.18 
 
 		 469 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1612  putative PAS/PAC sensor protein  57.14 
 
 		 305 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244603  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  55.96 
 
 		 471 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1266  metal dependent phosphohydrolase  50.93 
 
 		 631 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  54.55 
 
 		 458 aa  124  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 359 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  52.94 
 
 		 643 aa  123  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  56.86 
 
 		 389 aa  123  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  48.18 
 
 		 446 aa  120  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  50.98 
 
 		 643 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  50.98 
 
 		 643 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  50.98 
 
 		 643 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  50.98 
 
 		 643 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  55 
 
 		 358 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  48.18 
 
 		 642 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  47.27 
 
 		 642 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  47.27 
 
 		 642 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  52.94 
 
 		 361 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 452 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50.98 
 
 		 363 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1999  putative metal dependent phosphohydrolase  50.53 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0357211  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  48.45 
 
 		 452 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  44.34 
 
 		 703 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  44.34 
 
 		 703 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.1 
 
 		 348 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.9 
 
 		 347 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  45.79 
 
 		 481 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 		 347 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  52.87 
 
 		 364 aa  94.7  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  44.33 
 
 		 357 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  46.32 
 
 		 465 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2866  metal dependent phosphohydrolase  42.57 
 
 		 432 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.128247  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  41.35 
 
 		 349 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  40.78 
 
 		 487 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  43.12 
 
 		 876 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  43.14 
 
 		 632 aa  92.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0162  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  48.48 
 
 		 837 aa  92  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  43.4 
 
 		 495 aa  92  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  47.37 
 
 		 792 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  45.45 
 
 		 353 aa  89.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44 
 
 		 357 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  40.59 
 
 		 350 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  46.53 
 
 		 712 aa  87.8  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  41.12 
 
 		 509 aa  88.2  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  41.51 
 
 		 615 aa  87.8  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  46.32 
 
 		 841 aa  88.2  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 		 348 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 		 545 aa  87  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1939  GAF domain/His kinase A domain/HD domain-containing protein  39.42 
 
 		 787 aa  87  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0111  metal dependent phosphohydrolase  39.81 
 
 		 228 aa  87  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.153504  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  46.32 
 
 		 836 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  40.59 
 
 		 692 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  44 
 
 		 320 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  37.61 
 
 		 407 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.81 
 
 		 508 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  40.57 
 
 		 438 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.62 
 
 		 513 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 		 430 aa  84.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.82 
 
 		 719 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  40.37 
 
 		 710 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1828  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.57 
 
 		 379 aa  84.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  38.68 
 
 		 618 aa  84.7  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  39.05 
 
 		 326 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  42.11 
 
 		 803 aa  84.3  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 371 aa  84.3  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  40.91 
 
 		 553 aa  84  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  41 
 
 		 960 aa  84  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  42 
 
 		 357 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0627  metal dependent phosphohydrolase  40.78 
 
 		 420 aa  84  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  40.2 
 
 		 377 aa  83.6  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  40.2 
 
 		 373 aa  83.6  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  40.2 
 
 		 377 aa  83.6  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  40.2 
 
 		 374 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  46.81 
 
 		 548 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  39.6 
 
 		 545 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  40.59 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  43.27 
 
 		 868 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  36.79 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 363 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 755 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00423484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41 
 
 		 357 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3523  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.43 
 
 		 363 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  40.2 
 
 		 374 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  42.27 
 
 		 428 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  37.38 
 
 		 451 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41 
 
 		 357 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>