More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0027 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0027  putative aspartate/ornithine carbamoyltransferase family protein  100 
 
 		 287 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0647604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3641  aspartate/ornithine carbamoyltransferase carbamoyl-P binding domain protein  58.16 
 
 		 289 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3339  aspartate/ornithine carbamoyltransferase carbamoyl-P binding domain  58.39 
 
 		 289 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.253857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  29.87 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  30.92 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  29.57 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  29.57 
 
 		 330 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1073  ornithine carbamoyltransferase  28.48 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  27.27 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  26.6 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  26.44 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1334  ornithine carbamoyltransferase  28.38 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0126096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0831  aspartate/ornithine carbamoyltransferase carbamoyl-P binding domain protein  36.19 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  27.96 
 
 		 308 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  31.15 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  30.36 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  26.56 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28754  Ornithine carbamoyltransferase  27 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  26.32 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  26.42 
 
 		 355 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  27.76 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  29.32 
 
 		 317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  29.24 
 
 		 309 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  27.57 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  28.09 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0775  ornithine carbamoyltransferase  27 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.592297  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  26.47 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  28.71 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1861  aspartate/ornithine carbamoyltransferase carbamoyl-P binding domain protein  36.48 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  28.34 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  29.45 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  25.66 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0394  ornithine carbamoyltransferase  29.03 
 
 		 312 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  27.72 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0258  ornithine carbamoyltransferase  25 
 
 		 301 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1380  ornithine carbamoyltransferase  26.4 
 
 		 338 aa  112  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  25.66 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  29.84 
 
 		 314 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  24.92 
 
 		 329 aa  112  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  27.3 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  26.17 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4274  ornithine carbamoyltransferase  25.82 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0242541  normal  0.315958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  28.9 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  26.45 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  26.17 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3707  ornithine carbamoyltransferase  25.5 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0238  ornithine carbamoyltransferase  25.5 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1248  ornithine carbamoyltransferase  27.54 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  25.91 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3903  ornithine carbamoyltransferase  25.5 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  26.82 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  28.95 
 
 		 308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1323  ornithine carbamoyltransferase  28.15 
 
 		 338 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0534  ornithine carbamoyltransferase  25.67 
 
 		 371 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  24.83 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  27.48 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  27.36 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0252  ornithine carbamoyltransferase  28.03 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  25 
 
 		 305 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  25.5 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1046  ornithine carbamoyltransferase  26 
 
 		 330 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  26.23 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  23.73 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  27.03 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  27.3 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  25 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  25.08 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  26.69 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4012  ornithine carbamoyltransferase  24.75 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.875127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  27.92 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1731  ornithine carbamoyltransferase  28.9 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  26.69 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  27.34 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  27.45 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  26.69 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  26.07 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  25.99 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  28.67 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  24.76 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  28.43 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  27.3 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  27.95 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  27.27 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  27.7 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  27.65 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4122  ornithine carbamoyltransferase  25.08 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4093  ornithine carbamoyltransferase  24.75 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4211  ornithine carbamoyltransferase  25.08 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  27.03 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  30.45 
 
 		 311 aa  105  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  28 
 
 		 311 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  28 
 
 		 311 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  26.35 
 
 		 309 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0277  ornithine carbamoyltransferase  25.99 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0558  ornithine carbamoyltransferase  24.67 
 
 		 371 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  25.66 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  27.72 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  28.43 
 
 		 306 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  28.06 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  26.77 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>