More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS3067 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS3067  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit alpha  100 
 
 
296 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.589265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3307  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit alpha  100 
 
 
296 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3287  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  97.64 
 
 
296 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2483  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  97.3 
 
 
296 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5570  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  94.58 
 
 
295 aa  513  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.260199 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1073  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  60.96 
 
 
293 aa  328  7e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000230696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2834  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  58.56 
 
 
290 aa  328  8e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3892  L-serine dehydratase, alpha subunit  58.22 
 
 
292 aa  323  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4208  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  58.08 
 
 
292 aa  323  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4271  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  58.08 
 
 
292 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0989  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  58.08 
 
 
292 aa  322  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4161  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  58.08 
 
 
292 aa  322  6e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4046  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit alpha  58.08 
 
 
292 aa  322  6e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4360  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit alpha  58.08 
 
 
292 aa  322  6e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2554  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  57.93 
 
 
299 aa  322  7e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2606  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  57.93 
 
 
299 aa  322  7e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3884  L-serine dehydratase, alpha subunit  58.08 
 
 
292 aa  321  8e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4247  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  58.08 
 
 
292 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1076  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  56.21 
 
 
297 aa  319  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.036098  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2094  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  57.73 
 
 
299 aa  319  3e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3970  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  57.39 
 
 
292 aa  318  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1966  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  55.74 
 
 
294 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0888  L-serine ammonia-lyase / 2-hydroxymethylglutarate dehydratase  51.72 
 
 
287 aa  268  7e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00304555  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2146  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  51.03 
 
 
290 aa  267  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.284202  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1283  L-serine dehydratase alpha subunit  49.14 
 
 
289 aa  259  4e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.199144  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1253  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  49.31 
 
 
294 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2643  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  45.99 
 
 
293 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2960  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  45.64 
 
 
293 aa  255  6e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1058  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  44.76 
 
 
292 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1421  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  49.82 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316402  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1759  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  47.75 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1506  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  46.21 
 
 
296 aa  237  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0178055  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1246  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  46.86 
 
 
292 aa  236  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490782  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16330  L-serine ammonia-lyase, alpha subunit  46.34 
 
 
288 aa  226  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.59813e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2854  L-serine ammonia-lyase  43.9 
 
 
304 aa  224  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0174652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1459  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  41.58 
 
 
292 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000185683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3835  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  47.12 
 
 
287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338413  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0952  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  46.32 
 
 
536 aa  210  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235834 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0098  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  39.37 
 
 
291 aa  203  4e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000117533  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16320  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit/L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  45.97 
 
 
552 aa  197  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  hitchhiker  0.00195001 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1474  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  38.75 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1331  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  40.48 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.742186  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10070  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit/L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  43.97 
 
 
541 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000332749  hitchhiker  0.0000000458611 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1946  L-serine ammonia-lyase  44.25 
 
 
313 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.426247  hitchhiker  0.000000256832 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0503  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  45.56 
 
 
549 aa  181  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.742023 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0337  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  44.39 
 
 
286 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.794758  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2065  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  35.76 
 
 
293 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000167711  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0198  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  38.16 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000157551  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0267  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  38.32 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2892  L-serine dehydratase 1  37.68 
 
 
458 aa  162  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10673  L-serine dehydratase  33.56 
 
 
477 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.436502  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12590  L-serine ammonia-lyase  34.82 
 
 
464 aa  151  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.82368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0917  serine dehydratase alpha chain  35.91 
 
 
406 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  36 
 
 
470 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3111  L-serine ammonia-lyase  39.75 
 
 
404 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3256  L-serine dehydratase 1  35.86 
 
 
456 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  35.97 
 
 
460 aa  148  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0854  hypothetical protein  36.88 
 
 
458 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0828  hypothetical protein  36.88 
 
 
458 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4709  L-serine dehydratase 1  34.71 
 
 
475 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0084  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  36.36 
 
 
399 aa  146  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.644978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6183  L-serine dehydratase 1  36.82 
 
 
457 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1077  L-serine dehydratase  43.09 
 
 
458 aa  145  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2771  L-serine ammonia-lyase  36.68 
 
 
464 aa  145  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1149  L-serine dehydratase 1  35.56 
 
 
499 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2874  L-serine dehydratase 1  43.65 
 
 
457 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.30844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3617  L-serine ammonia-lyase  36.43 
 
 
458 aa  145  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0736152  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6246  L-serine dehydratase 1  35 
 
 
455 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187309  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0679  L-serine dehydratase 1  33.68 
 
 
460 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01908  L-serine dehydratase 1  33.33 
 
 
453 aa  143  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003155  L-serine dehydratase  33.33 
 
 
453 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.225865  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  44.2 
 
 
473 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  37.45 
 
 
463 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0213  L-serine dehydratase 1  35.38 
 
 
462 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1962  L-serine ammonia-lyase / 2-hydroxymethylglutarate dehydratase  37.63 
 
 
457 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4265  L-serine ammonia-lyase  37.6 
 
 
460 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3620  L-serine dehydratase 1  35.8 
 
 
467 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.294532  normal  0.0574017 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2109  L-serine dehydratase 1  42.08 
 
 
472 aa  143  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  36.74 
 
 
459 aa  142  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2900  L-serine dehydratase 1  35.74 
 
 
458 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1625  L-serine dehydratase 1  34.86 
 
 
458 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0594859  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2070  serine dehydratase alpha chain  35.27 
 
 
403 aa  142  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01784  L-serine deaminase I  34.52 
 
 
454 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1374  L-serine ammonia-lyase 1  34.52 
 
 
454 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.779144  normal  0.0170145 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1829  L-serine dehydratase 1  34.52 
 
 
454 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.693137  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1819  L-serine dehydratase 1  34.52 
 
 
454 aa  142  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2543  L-serine ammonia-lyase 1  34.52 
 
 
454 aa  142  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01772  hypothetical protein  34.52 
 
 
454 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1904  L-serine dehydratase 1  34.52 
 
 
454 aa  142  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2075  L-serine ammonia-lyase 1  34.52 
 
 
454 aa  142  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0608  L-serine dehydratase 1  42.54 
 
 
476 aa  142  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2042  L-serine dehydratase 1  34.52 
 
 
454 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  34.49 
 
 
458 aa  142  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.138393 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04899  L-serine dehydratase  41.99 
 
 
456 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01946  L-serine dehydratase 1  36.47 
 
 
457 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0568801  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0897  L-serine dehydratase 1  37.5 
 
 
450 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266509  normal  0.482369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33030  L-serine dehydratase  32.99 
 
 
458 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518916  hitchhiker  0.000319155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0518  L-serine dehydratase 1  34.6 
 
 
457 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3112  serine dehydratase alpha chain  34.44 
 
 
410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0667312  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0052  L-serine ammonia-lyase  35.54 
 
 
462 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>