More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1210 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1210  RNA pseudouridine synthase  100 
 
 		 499 aa  1025    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.125933  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0206  RNA pseudouridylate synthase family protein  56.07 
 
 		 598 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0185  RNA pseudouridylate synthase family protein  55.83 
 
 		 598 aa  430  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3036  RNA-binding S4 domain-containing protein  61.34 
 
 		 576 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246075  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0428  pseudouridine synthase, Rsu  53.32 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0416  pseudouridine synthase  55.05 
 
 		 576 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.561279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0522  RNA-binding S4 domain protein  58.24 
 
 		 698 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.575781 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0477  RNA-binding S4 domain protein  73.49 
 
 		 689 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53583  normal  0.544761 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0910  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  55.61 
 
 		 704 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237604  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3171  pseudouridine synthase, Rsu  52.31 
 
 		 687 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.601748  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4170  RNA-binding S4 domain protein  57.91 
 
 		 674 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3861  RNA-binding S4 domain-containing protein  57.58 
 
 		 669 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1273  pseudouridine synthase Rsu  64.92 
 
 		 795 aa  353  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.897048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1356  RNA-binding S4 domain protein  55.84 
 
 		 736 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2550  pseudouridine synthase, Rsu  64.75 
 
 		 680 aa  351  1e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0219746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1701  putative pseudouridine synthase, Rsu  65.71 
 
 		 690 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0069  RNA-binding S4 domain-containing protein  60.53 
 
 		 601 aa  349  8e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0907  pseudouridine synthase Rsu  64.08 
 
 		 743 aa  346  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1171  pseudouridine synthase Rsu  65.73 
 
 		 784 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4321  RNA-binding S4 domain protein  60 
 
 		 577 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0568238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6055  RNA-binding S4 domain-containing protein  61.09 
 
 		 609 aa  343  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228541  normal  0.392617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6591  RNA-binding S4 domain protein  63.49 
 
 		 576 aa  342  9e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351846  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3094  RNA-binding S4 domain-containing protein  64.23 
 
 		 620 aa  341  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2874  RNA-binding S4 domain protein  62 
 
 		 676 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0536834 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0644  RNA-binding S4 domain-containing protein  63.68 
 
 		 327 aa  314  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2376  RNA-binding S4 domain-containing protein  60.64 
 
 		 528 aa  310  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.000179936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0940  RNA-binding S4 domain-containing protein  62.98 
 
 		 489 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811015  normal  0.643203 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2266  pseudouridine synthase  62.98 
 
 		 508 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1217  pseudouridine synthase, Rsu  60.59 
 
 		 296 aa  301  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2231  RNA-binding S4 domain-containing protein  59.07 
 
 		 466 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00234161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0652  pseudouridine synthase, Rsu  60 
 
 		 293 aa  295  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0843984  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1927  pseudouridine synthase, Rsu  57.68 
 
 		 422 aa  295  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975227  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1478  RNA-binding S4 domain-containing protein  61.37 
 
 		 247 aa  295  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367389  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0618  pseudouridine synthase, Rsu  55.47 
 
 		 372 aa  290  5.0000000000000004e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0879771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2790  RNA pseudouridine synthase  59.24 
 
 		 322 aa  289  8e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4142  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.66 
 
 		 457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4639  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.44 
 
 		 501 aa  269  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2009  RNA-binding S4 domain protein  56.22 
 
 		 264 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2705  pseudouridine synthase  55.56 
 
 		 286 aa  259  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0707065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1297  pseudouridine synthase, Rsu  52.84 
 
 		 270 aa  244  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445377  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1058  pseudouridine synthase, Rsu  55.45 
 
 		 285 aa  239  5.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.042394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2070  pseudouridine synthase  45.98 
 
 		 271 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0652133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1403  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.2 
 
 		 247 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2567  RNA pseudouridylate synthase family protein  38.25 
 
 		 502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00446007  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1038  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40 
 
 		 332 aa  163  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0581  pseudouridine synthase  42.06 
 
 		 278 aa  163  7e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.826332  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1737  RNA pseudouridine synthase family protein  37.85 
 
 		 554 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0207122  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0178  RNA pseudouridine synthase family protein  37.85 
 
 		 554 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491144  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0988  RNA pseudouridine synthase family protein  37.85 
 
 		 554 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1510  RNA pseudouridine synthase family protein  37.85 
 
 		 554 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1912  RNA pseudouridylate synthase family protein  37.85 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2728  pseudouridine synthase  42.86 
 
 		 274 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1096  pseudouridine synthase  40.49 
 
 		 417 aa  161  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1759  RNA pseudouridine synthase family protein  37.45 
 
 		 554 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0328  pseudouridine synthase  43.36 
 
 		 567 aa  161  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1758  pseudouridine synthase  38.87 
 
 		 554 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.324653  normal  0.0138956 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1089  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.86 
 
 		 290 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2034  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  36.71 
 
 		 631 aa  160  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.209025 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1286  hypothetical protein  40 
 
 		 598 aa  160  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0722025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2823  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  34.67 
 
 		 633 aa  160  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1230  pseudouridine synthase  42.47 
 
 		 587 aa  159  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0560095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2505  pseudouridine synthase  44.12 
 
 		 239 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1629  pseudouridine synthase  36.7 
 
 		 626 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621954 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1064  RNA pseudouridylate synthase family protein  39.08 
 
 		 380 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1732  pseudouridine synthase  39.26 
 
 		 597 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1172  pseudouridine synthase  42.67 
 
 		 266 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.8005300000000004e-32 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2031  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  37.35 
 
 		 615 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1419  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.65 
 
 		 572 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0617825 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2824  pseudouridine synthase, Rsu  42.86 
 
 		 289 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.564406  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1379  pseudouridine synthase, Rsu  37.65 
 
 		 572 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1292  pseudouridine synthase  45.61 
 
 		 251 aa  157  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1722  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  37.91 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.950771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3089  pseudouridine synthase  42.67 
 
 		 266 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000212991  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1217  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  42.54 
 
 		 258 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000897909  hitchhiker  0.000000206079 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1473  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.77 
 
 		 586 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1301  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.36 
 
 		 236 aa  156  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1016  pseudouridine synthase, Rsu  38.77 
 
 		 586 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.718536  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2001  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.67 
 
 		 686 aa  156  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.850732  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1497  pseudouridine synthase, Rsu  38.77 
 
 		 586 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4638  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.77 
 
 		 588 aa  156  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.386925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0166  pseudouridine synthase  42.73 
 
 		 556 aa  156  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3394  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.37 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000468714  normal  0.359184 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1793  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  44.09 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1114  pseudouridine synthase  39.36 
 
 		 594 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1165  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  36.82 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1470  RNA-binding S4 domain protein  44.09 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.177762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4592  pseudouridine synthase  42.67 
 
 		 624 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.667434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1207  pseudouridine synthase  39.36 
 
 		 594 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.948896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1085  pseudouridine synthase  34.96 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3519  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.32 
 
 		 355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1162  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.35 
 
 		 328 aa  153  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1689  pseudouridine synthase  41.07 
 
 		 379 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0924391  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2873  pseudouridine synthase  42.86 
 
 		 736 aa  153  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0689  pseudouridine synthase  40.43 
 
 		 253 aa  153  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1867  pseudouridine synthase  39.05 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.919575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2312  pseudouridine synthase, Rsu  39.31 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.49516  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1419  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.18 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.829241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2455  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.95 
 
 		 340 aa  152  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.155456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1041  pseudouridine synthase, Rsu  42.53 
 
 		 268 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0593866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23110  hypothetical protein  41.2 
 
 		 386 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>