20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03313 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0205  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  353  6.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0644675 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03313  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  353  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4871  transcriptional regulator GadE  100 
 
 		 175 aa  353  6.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.904835 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3814  transcriptional regulator GadE  100 
 
 		 175 aa  353  6.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.050045 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3998  transcriptional regulator GadE  100 
 
 		 175 aa  353  6.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3714  transcriptional regulator GadE  100 
 
 		 175 aa  353  6.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117087  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0202  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 175 aa  353  6.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03360  DNA-binding transcriptional activator  100 
 
 		 175 aa  353  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3910  transcriptional regulator GadE  99.43 
 
 		 175 aa  350  5e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3800  transcriptional regulator DctR  23.95 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.202251 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3709  transcriptional regulator DctR  23.95 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000297163  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3993  transcriptional regulator DctR  23.95 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03355  predicted DNA-binding ranscriptional regulator  23.95 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.356816  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0210  LuxR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0333498 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0207  transcriptional regulator, LuxR family  23.95 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4855  transcriptional regulator DctR  23.95 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03308  hypothetical protein  23.95 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3905  transcriptional regulator DctR  23.35 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 201 aa  42  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  40.8  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>