More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_06130 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_06130  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 231 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08730  50S ribosomal protein L1  91.77 
 
 		 231 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000385028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0827  50S ribosomal protein L1  91.77 
 
 		 231 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0116287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3919  50S ribosomal protein L1  88.74 
 
 		 231 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4759  50S ribosomal protein L1  87.01 
 
 		 231 aa  390  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00425214  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0616  ribosomal protein L1  84.85 
 
 		 231 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4558  50S ribosomal protein L1  84.85 
 
 		 231 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759483  normal  0.0544864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5089  50S ribosomal protein L1  86.15 
 
 		 231 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000142036  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0444  50S ribosomal protein L1  86.09 
 
 		 231 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.833491  unclonable  0.000000290351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0477  50S ribosomal protein L1  86.09 
 
 		 231 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000803824  normal  0.0129211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0474  50S ribosomal protein L1  84.78 
 
 		 231 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4286  50S ribosomal protein L1  71.43 
 
 		 233 aa  343  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185505  hitchhiker  0.000000513776 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0595  50S ribosomal protein L1  70.13 
 
 		 233 aa  337  5.9999999999999996e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00100936  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0148  ribosomal protein L1  70.31 
 
 		 233 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000518131  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2334  50S ribosomal protein L1  73.59 
 
 		 231 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.505693  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0709  50S ribosomal protein L1  70.43 
 
 		 232 aa  333  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146158  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  69.87 
 
 		 282 aa  332  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1063  50S ribosomal protein L1  72.29 
 
 		 231 aa  330  8e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0602308  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4772  50S ribosomal protein L1  68.12 
 
 		 232 aa  330  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0687152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0411  50S ribosomal protein L1  72.81 
 
 		 230 aa  327  7e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.11869  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  69.87 
 
 		 231 aa  324  7e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0274  50S ribosomal protein L1  71.86 
 
 		 234 aa  323  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655427  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4392  50S ribosomal protein L1  70.56 
 
 		 234 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168999  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002170  LSU ribosomal protein L1p (L10Ae)  67.25 
 
 		 233 aa  322  4e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000179792  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00228  50S ribosomal protein L1  67.25 
 
 		 233 aa  322  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4556  50S ribosomal protein L1  70.56 
 
 		 234 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103924  decreased coverage  0.00000000000032652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4479  50S ribosomal protein L1  70.56 
 
 		 234 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0614276  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4482  50S ribosomal protein L1  70.56 
 
 		 234 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  decreased coverage  0.0000000000000063048 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4360  50S ribosomal protein L1  70.56 
 
 		 234 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0197515  normal  0.388445 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2869  50S ribosomal protein L1  66.52 
 
 		 234 aa  321  5e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000234009  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4700  50S ribosomal protein L1  70.74 
 
 		 233 aa  321  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000139189  hitchhiker  0.00000553638 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0189  50S ribosomal protein L1  70.43 
 
 		 233 aa  321  6e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000305059  hitchhiker  0.00355335 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0184  50S ribosomal protein L1  70.43 
 
 		 233 aa  321  6e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000067503  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0186  50S ribosomal protein L1  70 
 
 		 233 aa  321  7e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000837635  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0221  50S ribosomal protein L1  70.43 
 
 		 233 aa  321  7e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3734  ribosomal protein L1  70.56 
 
 		 234 aa  321  7e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0190  50S ribosomal protein L1  70 
 
 		 233 aa  321  7e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000340035  hitchhiker  0.000583899 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4066  50S ribosomal protein L1  70 
 
 		 233 aa  321  7e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000212774  normal  0.011135 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4472  50S ribosomal protein L1  70 
 
 		 233 aa  321  7e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3769  50S ribosomal protein L1  69.57 
 
 		 233 aa  318  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000012914  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4327  50S ribosomal protein L1  70 
 
 		 233 aa  318  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000769687  hitchhiker  0.00000000219942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0189  50S ribosomal protein L1  69.57 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324353  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0285  ribosomal protein L1  68.56 
 
 		 231 aa  316  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000742644  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0170  50S ribosomal protein L1  65.07 
 
 		 229 aa  315  3e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000255215  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03860  50S ribosomal protein L1  69.7 
 
 		 234 aa  315  5e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000865195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03813  hypothetical protein  69.7 
 
 		 234 aa  315  5e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000121828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4041  50S ribosomal protein L1  69.7 
 
 		 234 aa  315  5e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000597884  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5449  50S ribosomal protein L1  69.7 
 
 		 234 aa  315  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000118396  hitchhiker  0.00123384 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4472  50S ribosomal protein L1  69.7 
 
 		 234 aa  315  5e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362466  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4524  50S ribosomal protein L1  69.7 
 
 		 234 aa  315  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100001  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4432  50S ribosomal protein L1  69.7 
 
 		 234 aa  315  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000639921  hitchhiker  0.0000029085 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4217  50S ribosomal protein L1  69.7 
 
 		 234 aa  315  5e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.26604e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0868  ribosomal protein L1  65.07 
 
 		 231 aa  314  6e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0160  50S ribosomal protein L1  69.13 
 
 		 233 aa  314  7e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000041056  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3863  50S ribosomal protein L1  69.26 
 
 		 234 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2807  50S ribosomal protein L1  69.26 
 
 		 234 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532362  normal  0.121475 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2334  ribosomal protein L1  68.56 
 
 		 231 aa  313  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000592022  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0336  50S ribosomal protein L1  69.26 
 
 		 234 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00681469  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0203  50S ribosomal protein L1  69.26 
 
 		 233 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000988854  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4011  ribosomal protein L1  69.26 
 
 		 234 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271875  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0313  ribosomal protein L1  69.87 
 
 		 231 aa  312  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000426699  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3449  ribosomal protein L1  67.53 
 
 		 234 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000354008  hitchhiker  0.00724733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0194  50S ribosomal protein L1  69.26 
 
 		 234 aa  312  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000443465  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3888  ribosomal protein L1  68.83 
 
 		 234 aa  311  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0448  50S ribosomal protein L1P  70 
 
 		 231 aa  311  6.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  64.5 
 
 		 232 aa  310  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0138  50S ribosomal protein L1  69.13 
 
 		 233 aa  310  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000376196  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0174  50S ribosomal protein L1  70.87 
 
 		 233 aa  309  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0202  50S ribosomal protein L1  68.83 
 
 		 234 aa  309  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0394822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2727  50S ribosomal protein L1  68.4 
 
 		 233 aa  308  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000405483  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0207  50S ribosomal protein L1  68.83 
 
 		 234 aa  308  4e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000293924  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  64.5 
 
 		 232 aa  307  8e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3870  ribosomal protein L1  65.37 
 
 		 237 aa  307  8e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0324  50S ribosomal protein L1  63.04 
 
 		 232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1865  50S ribosomal protein L1  63.04 
 
 		 232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000283442  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  64.07 
 
 		 232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  62.34 
 
 		 232 aa  305  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  63.2 
 
 		 232 aa  305  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  63.2 
 
 		 232 aa  305  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  62.34 
 
 		 232 aa  305  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  61.9 
 
 		 232 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  61.9 
 
 		 232 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  61.9 
 
 		 232 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  62.34 
 
 		 232 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  62.34 
 
 		 232 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  62.34 
 
 		 232 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  62.34 
 
 		 232 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  62.34 
 
 		 232 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  62.34 
 
 		 232 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  62.34 
 
 		 232 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  62.34 
 
 		 232 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  63.64 
 
 		 231 aa  299  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  63.64 
 
 		 231 aa  298  7e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  63.64 
 
 		 231 aa  298  7e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2039  50S ribosomal protein L1  69.33 
 
 		 233 aa  297  9e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0921  50S ribosomal protein L1  70.56 
 
 		 231 aa  293  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251506  hitchhiker  0.00000172539 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0043  50S ribosomal protein L1  64.5 
 
 		 233 aa  292  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0746  50S ribosomal protein L1  64.16 
 
 		 232 aa  291  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.034048  normal  0.798017 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2180  50S ribosomal protein L1  67.56 
 
 		 233 aa  291  5e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.759489  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1890  50S ribosomal protein L1  67.56 
 
 		 233 aa  291  8e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.487201  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>