79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7588 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7588  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  600  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3423  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  40.61 
 
 
284 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04790  histidinol-phosphatase, putative  33.77 
 
 
349 aa  158  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07044  histidinol phosphatase (Eurofung)  34.4 
 
 
361 aa  149  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33066  histidinolphosphatase  30.48 
 
 
322 aa  114  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0754  HisJ family histidinol phosphate phosphatase  28.68 
 
 
274 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.511615  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1449  histidinol-phosphatase  31.13 
 
 
267 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000100301  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2182  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  28.47 
 
 
279 aa  102  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.076657  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0709  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  25.87 
 
 
278 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000475894  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1866  histidinol phosphate phosphatase, HisJ  26.01 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0632601  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0277  histidinol phosphate phosphatase, HisJ  28.09 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0760361  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0204  histidinol-phosphatase  27.74 
 
 
269 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1038  histidinol-phosphatase  26.22 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0665  histidinol-phosphatase  25.95 
 
 
268 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1053  histidinol phosphate phosphatase, HisJ  27.27 
 
 
259 aa  93.2  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0940  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  28.68 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1489  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  27.57 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2305  HisJ family histidinol phosphate phosphatase  23.74 
 
 
272 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.156876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1057  histidinol-phosphate phosphatase  24.44 
 
 
274 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2572  histidinol phosphate phosphatase, HisJ  29.08 
 
 
270 aa  85.5  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.343056  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1130  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  28.14 
 
 
262 aa  85.5  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.447072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2577  HisJ family histidinol phosphate phosphatase  24.81 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000583868  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0431  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  25.48 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1995  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  26.44 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000223549  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1608  histidinol-phosphatase  27.76 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1445  PHP domain-containing protein  26.82 
 
 
259 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0813592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2198  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  24.7 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00182011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0653  histidinol-phosphatase  28.5 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000617146  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2340  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  27.56 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1427  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  25.48 
 
 
269 aa  79  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.3472 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1558  histidinol-phosphatase  27.48 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.968485  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0366  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  27.05 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000535026  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1985  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  26.39 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142716  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11520  histidinol-phosphatase  26.64 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586519  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1502  histidinol-phosphatase  22.57 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1128  histidinol-phosphatase  24.82 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11335  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1312  histidinol-phosphatase  24.82 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000116782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0817  histidinol phosphate phosphatase, HisJ  26.53 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000179791  hitchhiker  0.00070784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03330  hypothetical protein  24.46 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230804  unclonable  6.29446e-22 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2903  HisJ family histidinol phosphate phosphatase  26.29 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000108995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4086  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  24.21 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1660  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  23.11 
 
 
259 aa  63.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000706584  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0351  PHP domain protein  26.02 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0185  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  22.53 
 
 
269 aa  62.8  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1348  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  25.1 
 
 
269 aa  62.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.621564 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1711  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  24.19 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00377284  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0801  sensory box protein/histidinol phosphate phosphatase family protein  23.85 
 
 
624 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3778  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  23.97 
 
 
278 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.157416  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1354  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  24.51 
 
 
283 aa  59.7  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1969  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  24.38 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000659407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0724  HisJ family histidinol phosphate phosphatase  23.14 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0198  HisJ family histidinol phosphate phosphatase  27.07 
 
 
240 aa  57  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000574159  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1620  HisJ family histidinol phosphate phosphatase  23.87 
 
 
259 aa  55.8  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.411064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1689  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  22.62 
 
 
277 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.380401 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0718  histidinol-phosphatase  24.41 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3432  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  26.27 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1927  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  22.58 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0644284  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1229  histidinol phosphate phosphatase family protein  22.18 
 
 
261 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.054354  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2386  PHP domain protein  28.19 
 
 
260 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1040  histidinol phosphatase, putative  21.1 
 
 
261 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000352754  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1325  histidinol-phosphate phosphatase  24.82 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2109  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  22.28 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15210  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  24.27 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00148301  normal  0.0896502 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1466  histidinol-phosphatase  22.83 
 
 
338 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1743  PHP domain protein  26.24 
 
 
258 aa  47  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69774  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3878  histidinol-phosphatase  23.21 
 
 
338 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0183  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  23.74 
 
 
280 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1335  histidinol-phosphatase  24.85 
 
 
339 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1533  histidinol-phosphatase  20.9 
 
 
338 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0785  HisJ family histidinol phosphate phosphatase  25.48 
 
 
240 aa  45.8  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2721  histidinol-phosphatase  23.11 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1572  histidinol-phosphatase  21.11 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  21.43 
 
 
569 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1504  histidinol-phosphatase  21.43 
 
 
338 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165134 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1297  histidinol-phosphatase  20.83 
 
 
339 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1709  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  22.35 
 
 
289 aa  42.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1298  histidinol-phosphatase  23.78 
 
 
338 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1432  histidinol-phosphatase  21.05 
 
 
338 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1324  histidinol-phosphatase  21.05 
 
 
338 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>