More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7483 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  43.76 
 
 		 1039 aa  803    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5103  acriflavin resistance protein  42.72 
 
 		 1044 aa  766    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.869946 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7283  Acr family transporter  62.62 
 
 		 1018 aa  1186    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  42.12 
 
 		 1044 aa  758    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  52.67 
 
 		 1405 aa  1006    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03086  transporter transmembrane protein  62.45 
 
 		 1034 aa  1216    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43508  normal  0.286784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  39.26 
 
 		 1031 aa  724    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1374  acriflavin resistance protein  42.06 
 
 		 1028 aa  732    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.244767  decreased coverage  0.0000403817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4034  acriflavin resistance protein  42.38 
 
 		 1037 aa  764    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2622  acriflavin resistance protein  55.05 
 
 		 1014 aa  1064    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  45.61 
 
 		 1036 aa  882    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0459  acriflavin resistance protein  51.67 
 
 		 1027 aa  1030    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  40.91 
 
 		 1050 aa  774    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3825  acriflavin resistance protein  44.05 
 
 		 1036 aa  785    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  53.27 
 
 		 1031 aa  1062    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  40.99 
 
 		 1042 aa  756    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1280  acriflavin resistance protein  44.46 
 
 		 1037 aa  765    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  43.68 
 
 		 1048 aa  805    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  41.77 
 
 		 1088 aa  765    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7483  Acr family transporter  100 
 
 		 1027 aa  2065    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3922  acriflavin resistance protein  43.33 
 
 		 1046 aa  781    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.081539 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5613  acriflavin resistance protein  66.86 
 
 		 1050 aa  1361    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2927  acriflavin resistance protein  41.27 
 
 		 1009 aa  741    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3045  acriflavin resistance protein  39.81 
 
 		 1108 aa  701    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5659  acriflavin resistance protein  62.56 
 
 		 1022 aa  1260    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.891494  normal  0.720908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0430  acriflavin resistance protein  41.87 
 
 		 1031 aa  726    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.31117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  40.85 
 
 		 1060 aa  759    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4744  acriflavin resistance protein  39.76 
 
 		 1028 aa  699    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.277916 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0039  acriflavin resistance protein  38.64 
 
 		 1060 aa  653    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  50.84 
 
 		 1031 aa  1011    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0885  acriflavin resistance protein  41.44 
 
 		 1053 aa  765    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3023  acriflavin resistance protein  42.79 
 
 		 1027 aa  764    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3300  acriflavin resistance protein  39.81 
 
 		 1108 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.992116  normal  0.412729 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  40.35 
 
 		 1058 aa  763    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4395  acriflavin resistance protein  43.42 
 
 		 1047 aa  777    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.882422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  50.78 
 
 		 1036 aa  1030    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2375  acriflavin resistance protein  41.91 
 
 		 1103 aa  746    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  40.35 
 
 		 1040 aa  754    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  45.37 
 
 		 1032 aa  870    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0466  acriflavin resistance protein  41.58 
 
 		 1031 aa  743    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0468485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2354  acriflavin resistance protein  44.67 
 
 		 1027 aa  851    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  42.38 
 
 		 1037 aa  788    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  37.99 
 
 		 1044 aa  692    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  41.87 
 
 		 1088 aa  767    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  52.7 
 
 		 1035 aa  1055    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  42.02 
 
 		 1043 aa  748    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  41.29 
 
 		 1088 aa  771    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0557  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  40.22 
 
 		 1046 aa  731    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644093  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  41.35 
 
 		 1042 aa  746    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4290  acriflavin resistance protein  43.42 
 
 		 1046 aa  781    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0982359  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  43.27 
 
 		 1018 aa  752    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  53.18 
 
 		 1033 aa  1023    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3464  Acr family transporter  40 
 
 		 1101 aa  712    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4664  acriflavin resistance protein  52.27 
 
 		 1025 aa  1014    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4107  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  42.22 
 
 		 1067 aa  757    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666055  normal  0.120279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  53.18 
 
 		 1033 aa  1023    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2967  acriflavin resistance protein  60.96 
 
 		 1032 aa  1212    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510734  normal  0.0225941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  51.03 
 
 		 1044 aa  1029    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  53.27 
 
 		 1031 aa  1061    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  49.15 
 
 		 1083 aa  979    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0397  acriflavin resistance protein  41.67 
 
 		 1031 aa  727    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.675147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  51.66 
 
 		 1028 aa  1041    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  32.61 
 
 		 1039 aa  509  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  32.05 
 
 		 1038 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  30.08 
 
 		 1496 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1067 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  29.33 
 
 		 1032 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  32.76 
 
 		 1065 aa  482  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  31.3 
 
 		 1070 aa  481  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  31.07 
 
 		 1036 aa  478  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 		 1095 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1055 aa  473  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  30.77 
 
 		 1470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  33.21 
 
 		 1054 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1054 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1041 aa  466  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  32.92 
 
 		 1054 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  31.25 
 
 		 1069 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  29.95 
 
 		 1034 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  30.39 
 
 		 1075 aa  452  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1058 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  32.32 
 
 		 1028 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1071 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1066 aa  445  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1043 aa  438  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  32.48 
 
 		 1028 aa  436  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  28.94 
 
 		 1050 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 		 1028 aa  429  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  29.1 
 
 		 1009 aa  429  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  29.41 
 
 		 1040 aa  426  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  28.47 
 
 		 1034 aa  429  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  29.08 
 
 		 1033 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.85 
 
 		 1043 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1011 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1033 aa  422  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.28 
 
 		 1024 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  28.75 
 
 		 1058 aa  416  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.43 
 
 		 1063 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1041 aa  412  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  29.13 
 
 		 1036 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>