136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2012 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2012  transposase  100 
 
 
337 aa  706    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315477  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0048  putative transposase  41.67 
 
 
320 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000000122957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0725  putative transposase  41.85 
 
 
318 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420818 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0147  transposase  39.06 
 
 
328 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.216525  normal  0.924195 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0206  putative transposase  39.38 
 
 
329 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0693887  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4134  putative transposase  37.78 
 
 
334 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436549  normal  0.202806 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1665  hypothetical protein  28.88 
 
 
313 aa  112  9e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0645935 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3708  ISSpo8, transposase  25.29 
 
 
329 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0919  hypothetical protein  23.05 
 
 
311 aa  86.3  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0081  ISSpo8, transposase  26.14 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462993  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01857  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02617  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  77  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06092  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05836  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02827  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04330  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000810616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00592  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0131  ISSpo8, transposase  24.57 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01918  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03119  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03315  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03664  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06250  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00625171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00429  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.901373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00947  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000842303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01069  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.168183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06219  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0124141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02578  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02591  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.317416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03214  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04595  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04081  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03780  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01807  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.156782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03695  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1156  ISSpo8, transposase  26.92 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0302963  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00484  ISXo5 transposase  25.95 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741552  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01725  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01861  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02486  ISXo5 transposase  25.57 
 
 
338 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03012  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03597  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5836  hypothetical protein  25.09 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03976  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03974  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00040  ISXo5 transposase  25.95 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.765513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00331  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02023  ISXo5 transposase  25.19 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02455  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02971  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03367  ISXo5 transposase  26.72 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03560  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.81013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3136  hypothetical protein  23.82 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0566917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3166  hypothetical protein  23.82 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02593  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03353  ISXo5 transposase  25.95 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3478  ISSpo8, transposase  25.76 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04224  ISXo5 transposase  26.34 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0733056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01870  ISXo5 transposase  25.95 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04634  ISXo5 transposase  25.95 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06032  ISXo5 transposase  25.95 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.978605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02993  ISXo5 transposase  25.95 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528498  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03338  ISXo5 transposase  25.95 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06059  ISXo5 transposase  25.19 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000704128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00868  ISXo5 transposase  25.19 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16246  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02306  ISXo5 transposase  25.95 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03228  ISXo5 transposase  25.95 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01473  ISXo5 transposase  25.95 
 
 
338 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02759  ISXo5 transposase  25.95 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2284  ISSod11, transposase  25.55 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4436  ISSod11, transposase  25.55 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0819  ISSod11, transposase  25.55 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1282  ISSod11, transposase  25.55 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1394  ISSod11, transposase  25.55 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1436  ISSod11, transposase  25.55 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1456  ISSod11, transposase  25.55 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1950  ISSod11, transposase  25.55 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2187  ISSod11, transposase  25.55 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2210  ISSod11, transposase  25.55 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2819  ISSod11, transposase  25.55 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3321  ISSod11, transposase  25.55 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04014  ISXo5 transposase  25.95 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01914  ISXoo10 transposase  25.68 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.474572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01494  ISXo2 putative transposase  23.93 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02702  ISXo5 transposase  26.14 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.222301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04109  ISXo2 putative transposase  23.4 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.933255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01491  transposase  27.49 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01827  putative transposase  27.75 
 
 
448 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.586106  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02567  transposase  27.49 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03653  ISXo2 putative transposase  23.05 
 
 
360 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1964  hypothetical protein  24.37 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2430  hypothetical protein  24.37 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2804  hypothetical protein  24.37 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.323871 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4157  hypothetical protein  24.37 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03600  ISXo2 putative transposase  23.05 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05468  hypothetical protein  23.16 
 
 
367 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00277  ISXo2 putative transposase  23.05 
 
 
484 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01966  ISXo2 putative transposase  23.05 
 
 
353 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000253564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03442  ISXo2 putative transposase  23.05 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00952  ISXo2 putative transposase  23.05 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>