9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1594 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1594  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  816    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1107  hypothetical protein  48.35 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.585839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1254  hypothetical protein  47.09 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0806  hypothetical protein  45.36 
 
 		 397 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5400  hypothetical protein  44.7 
 
 		 395 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64981  hitchhiker  0.00457848 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2540  hypothetical protein  29.52 
 
 		 421 aa  160  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143942  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1123  hypothetical protein  27.52 
 
 		 396 aa  154  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0752  hypothetical protein  26.76 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0321  hypothetical protein  28.85 
 
 		 278 aa  43.1  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>