287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1079 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1079  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  615  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.462642  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1670  diacylglycerol kinase catalytic region  32.44 
 
 
316 aa  122  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.630267 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2268  hypothetical protein  27.88 
 
 
305 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2295  hypothetical protein  26.86 
 
 
305 aa  115  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2148  diacylglycerol kinase catalytic region  30.3 
 
 
314 aa  115  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1424  diacylglycerol kinase catalytic region  31.68 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1322  diacylglycerol kinase catalytic region  31.68 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.772266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2527  hypothetical protein  31.68 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.973765  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0393  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.62 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0393706  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_357  hypothetical protein  27.96 
 
 
301 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000445799  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0414  hypothetical protein  27.63 
 
 
301 aa  107  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0557912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0869  diacylglycerol kinase catalytic region  28.01 
 
 
307 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  26.13 
 
 
303 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15890  conserved protein of unknown function BmrU  27.16 
 
 
308 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000178842  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0717  diacylglycerol kinase catalytic region  28.1 
 
 
314 aa  96.7  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.478099  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  30.68 
 
 
302 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  30.68 
 
 
302 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1339  diacylglycerol kinase catalytic region  29.49 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.219636 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2400  diacylglycerol kinase, catalytic region  25.58 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  30.29 
 
 
312 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  28.95 
 
 
314 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  27.36 
 
 
300 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  27.04 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4976  bmrU protein  27.04 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  27.83 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  27.15 
 
 
312 aa  89.4  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  26.71 
 
 
300 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  29.13 
 
 
291 aa  89  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4570  diacylglycerol kinase  26.71 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3762  diacylglycerol kinase  26.14 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1884  diacylglycerol kinase catalytic region  29.6 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208572  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  26.71 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  27.76 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  28.4 
 
 
294 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  26.71 
 
 
300 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  26.38 
 
 
300 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  26.38 
 
 
300 aa  86.3  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5075  diacylglycerol kinase family protein  26.38 
 
 
300 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  29.39 
 
 
299 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  29.58 
 
 
308 aa  86.3  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  27.97 
 
 
291 aa  85.9  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  29.23 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1610  diacylglycerol kinase catalytic region  23.41 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0418  diacylglycerol kinase catalytic region  24.2 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2441  diacylglycerol kinase catalytic region  30.24 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0894  diacylglycerol kinase catalytic region  29.22 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.495381  normal  0.488234 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  25.99 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0561  diacylglycerol kinase, catalytic region  25.49 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.323865  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2734  hypothetical protein  30.89 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3028  diacylglycerol kinase catalytic region  29.49 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823655  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  28 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2771  diacylglycerol kinase  25.82 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148668  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0576  diacylglycerol kinase catalytic region  25.49 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  26.23 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1811  diacylglycerol kinase catalytic region  26.86 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1185  diacylglycerol kinase family protein  26.27 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000148209  normal  0.309061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  27.3 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3700  diacylglycerol kinase catalytic region  29.22 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  27.67 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2392  diacylglycerol kinase catalytic region  26.62 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  27.36 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12281  diacylglycerol kinase  27.45 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.538329  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3375  diacylglycerol kinase  25.82 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0813  diacylglycerol kinase catalytic region  22.93 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3437  diacylglycerol kinase  25.82 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00697361  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3386  diacylglycerol kinase  25.82 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  26.6 
 
 
309 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1293  diacylglycerol kinase, catalytic region  31.17 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.13381  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  28.29 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.06 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  26.6 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  26.67 
 
 
326 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2507  lipid kinase  26.95 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.594101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3057  hypothetical protein  26.61 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2062  diacylglycerol kinase catalytic region  31.65 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0353478  normal  0.170791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2760  diacylglycerol kinase catalytic region  26.86 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0246521  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2655  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.63 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  26.74 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1766  hypothetical protein  27.15 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000301  methylglyoxal synthase  25.95 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.235944  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2518  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.79 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01680  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  27.88 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.633077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2701  lipid kinase  27.57 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01350  conserved protein of unknown function BmrU  26.85 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.956318  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  24.92 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18510  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  28.98 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0650618  normal  0.0224505 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  24.92 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0633  diacylglycerol kinase catalytic region  22.6 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000157302  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1516  diacylglycerol kinase catalytic region  29.01 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.251162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1757  diacylglycerol kinase catalytic region  28.17 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2152  lipid kinase  25 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.052393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1711  diacylglycerol kinase catalytic region  25.95 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  24.92 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0248  diacylglycerol kinase catalytic region  29.1 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00504383  hitchhiker  0.00109168 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0601  diacylglycerol kinase catalytic region  27.04 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.902429  normal  0.638771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  27.27 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  24.6 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  24.6 
 
 
301 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1231  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.59 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  24.6 
 
 
301 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>