14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0025 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0025  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  435  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5152  hypothetical protein  83.72 
 
 		 222 aa  357  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2810  hypothetical protein  73.02 
 
 		 223 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801311  normal  0.0200816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3076  hypothetical protein  76.28 
 
 		 223 aa  323  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1579  hypothetical protein  67.91 
 
 		 225 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.638089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3893  hypothetical protein  65.74 
 
 		 232 aa  301  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.875186 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2102  hypothetical protein  68.84 
 
 		 224 aa  296  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0373  hypothetical protein  61.21 
 
 		 225 aa  277  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0327  hypothetical protein  60.28 
 
 		 254 aa  275  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0457  hypothetical protein  62.8 
 
 		 212 aa  262  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0595  hypothetical protein  46.41 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.0924947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2922  hypothetical protein  45.12 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.315719  normal  0.130467 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3728  hypothetical protein  39.73 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3423  hypothetical protein  41.4 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>