More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_5042 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_5042  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  100 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319742  normal  0.272315 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0765  hypothetical protein  73.5 
 
 		 235 aa  356  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.417208  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3545  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  59.04 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1295  protein of unknown function DUF558  56.41 
 
 		 239 aa  268  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1323  protein of unknown function DUF558  55.98 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.107771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1175  protein of unknown function DUF558  55.51 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4176  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  53.36 
 
 		 243 aa  224  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0806  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  49.79 
 
 		 243 aa  192  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1513  hypothetical protein  38.22 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.680118  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3110  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  36.73 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00328118  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07811  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  34.41 
 
 		 251 aa  128  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244277 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01646  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  36 
 
 		 244 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2161  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  35.29 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1319  hypothetical protein  32.64 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3218  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.74 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000318733  hitchhiker  0.0000151601 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1997  protein of unknown function DUF558  37.61 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1016  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.61 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3082  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  34.73 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.584805  normal  0.179452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1587  hypothetical protein  38.57 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.721814  normal  0.561066 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2434  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.98 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454475  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0268  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  37.18 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104604 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07251  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.73 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3241  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  38.57 
 
 		 234 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.108692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1722  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  36.1 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2076  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2054  hypothetical protein  34.58 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1186  protein of unknown function DUF558  39.46 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0115216 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3037  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.99 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000274607  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0610  protein of unknown function DUF558  34.65 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1285  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  34.89 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0100  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.92 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12770  conserved hypothetical protein TIGR00046  30.99 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000425435  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2303  hypothetical protein  32.08 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1823  hypothetical protein  34.84 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432103  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1925  protein of unknown function DUF558  36 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0289082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5288  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  34.1 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2283  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.98 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0479  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  32.72 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0047  hypothetical protein  31.47 
 
 		 251 aa  108  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14251  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  35.66 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2493  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.13 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2251  hypothetical protein  34.16 
 
 		 245 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00851758  unclonable  0.000000139128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0453  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.18 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0247  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.62 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2370  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  32.62 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00405719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0995  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  35.54 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1192  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.33 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0525282  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0143  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  35.24 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5076  conserved hypothetical protein TIGR00046  34.25 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1998  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.7 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07411  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.63 
 
 		 259 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.54697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4289  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.33 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00156993  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0838  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  38.35 
 
 		 230 aa  105  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.083399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05450  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.86 
 
 		 240 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0519  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.98 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0806  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.86 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000483246  decreased coverage  9.34554e-23 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0162  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.75 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4162  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.99 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00520295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1795  protein of unknown function DUF558  33.33 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0420  protein of unknown function DUF558  31.36 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1732  hypothetical protein  31.67 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.127797  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07231  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.83 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.419144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0587  hypothetical protein  32.91 
 
 		 246 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.256095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4985  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.41 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4430  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.58 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1295  hypothetical protein  34.1 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0337  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  34.35 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0097  protein of unknown function DUF558  35.96 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0201  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  32.6 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5035  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.96 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4444  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.45 
 
 		 249 aa  101  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000243025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4392  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.45 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0158003  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2182  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.64 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000164058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4210  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.58 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0876638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4048  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.58 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.702448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4058  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.58 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0577638  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4333  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.58 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.98604e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4536  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.58 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0467  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4859  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.41 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.771335  normal  0.0487283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0412  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.78 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0257  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.62 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.58191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0090  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.33 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1461  protein of unknown function DUF558  30.2 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.7294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0268  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.62 
 
 		 240 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0317407  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03291  hypothetical protein  31.3 
 
 		 242 aa  99  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3004  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  29.74 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1212  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.84 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3079  hypothetical protein  30.64 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1575  hypothetical protein  26.89 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0110049  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3975  protein of unknown function DUF558  29.31 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2865  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  29.79 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03190  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.18 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3944  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  35.35 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0227  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.63 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0668  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  28.51 
 
 		 257 aa  95.5  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0450086  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0018  hypothetical protein  31.46 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4321  hypothetical protein  30.49 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3038  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.4 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3334  hypothetical protein  29.91 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>