20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0041 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_R0041  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0048  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0049  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0048  tRNA-Arg  86.11 
 
 
74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.195029  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0046  tRNA-Arg  96.88 
 
 
77 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497461 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0050  tRNA-Arg  86.11 
 
 
74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0050  tRNA-Arg  86.11 
 
 
74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0035  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0009  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0048  tRNA-Arg  85.51 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544929  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0014  tRNA-Arg  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.951342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0037  tRNA-Arg  83.1 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0042  tRNA-Arg  96.15 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0110634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0047  tRNA-Arg  96.15 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0041  tRNA-Arg  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0018  tRNA-Arg  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000528633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0021  tRNA-Arg  96.15 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191091  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0022  tRNA-Arg  96.15 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00550976  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>