More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1557 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1557  pseudouridine synthase  100 
 
 		 311 aa  633  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.343366  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1962  RluA family pseudouridine synthase  34.85 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0347  pseudouridine synthase, RluA family  35.89 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2789  RluA family pseudouridine synthase  34.65 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1777  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.42 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00553261  decreased coverage  0.000101871 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2435  pseudouridine synthase, RluA family  30.69 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.267395  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.51 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2192  RluA family pseudouridine synthase  31.84 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677227  normal  0.0743981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0657  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.47 
 
 		 320 aa  122  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0704  pseudouridine synthase, RluD  30.69 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1414  RluA family pseudouridine synthase  32.75 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.003829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0632  pseudouridine synthase, RluD  29.85 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1112  RluA family pseudouridine synthase  29.85 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594641  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1070  RluA family pseudouridine synthase  29.85 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0527141  normal  0.0360601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4787  RluA family pseudouridine synthase  28.96 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1224  pseudouridylate synthase  32.4 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00465403  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0988  RluA family pseudouridine synthase  30.48 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0819  RluA family pseudouridine synthase  30.6 
 
 		 353 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0956515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0919  RluA family pseudouridine synthase  32.46 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.976861  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2801  RluA family pseudouridine synthase  31.48 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000617612  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1620  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.48 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00181118  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2490  RluA family pseudouridine synthase  31.48 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000151813  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0521  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.48 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2792  RluA family pseudouridine synthase  31.48 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449267  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1429  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  25.9 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1174  RluA family pseudouridine synthase  28.17 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2862  RluA family pseudouridine synthase  31.48 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0569131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1813  RluA family pseudouridine synthase  31.48 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0797823  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1093  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.71 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2006  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.92 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0073  pseudouridine synthase, RluA family  25.61 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2917  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.48 
 
 		 477 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00370322  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0992  RluA family pseudouridine synthase  30.11 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4165  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.35 
 
 		 320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0336491  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0056  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  26.47 
 
 		 339 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0061  pseudouridine synthase, RluA family  25.26 
 
 		 339 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0123  pseudouridine synthase  28.62 
 
 		 315 aa  115  7.999999999999999e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.352108  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0971  pseudouridine synthase, RluA family  30.83 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.158596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0278  RluA family pseudouridine synthase  29.1 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0322  pseudouridine synthase, RluA family  29.1 
 
 		 468 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.539792  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0059  RluA family pseudouridine synthase  26.47 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14313 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0596  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.1 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000579613  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2087  RluA family pseudouridine synthase  30.66 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0591  RluA family pseudouridine synthase  27.96 
 
 		 322 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0464018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1708  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30 
 
 		 477 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127697  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1721  pseudouridine synthase, RluD  31.07 
 
 		 346 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2175  pseudouridylate synthase  30.31 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1065  pseudouridine synthase, RluD  27.17 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.901288  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1589  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  27.74 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0462053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0461  pseudouridine synthase  35.06 
 
 		 233 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1111  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.86 
 
 		 343 aa  113  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.522532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1348  RluA family pseudouridine synthase  26.28 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.628416  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  27.85 
 
 		 302 aa  112  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0354  pseudouridine synthase, RluA family  28.73 
 
 		 446 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0906  pseudouridine synthase, RluA family  30.08 
 
 		 344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447686  normal  0.0333397 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0929  pseudouridine synthase  29.5 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.52 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3840  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.06 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.283554  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4224  pseudouridine synthase, RluD  28.52 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5281  RluA family pseudouridine synthase  28.19 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0773013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3624  pseudouridine synthase, RluA family  28.62 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1639  pseudouridine synthase, RluD  28.06 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.289887 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5034  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.62 
 
 		 458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0310  RluA family pseudouridine synthase  30.28 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1287  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D (pseudouridylate synthase) (Uracil hydrolyase)  26.29 
 
 		 321 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3129  pseudouridine synthase RluD  29.59 
 
 		 444 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411663  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2642  pseudouridine synthase, RluA family  27.8 
 
 		 339 aa  109  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704369  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6367  RluA family pseudouridine synthase  27.82 
 
 		 469 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129788  normal  0.347421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1063  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.15 
 
 		 323 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0781222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2274  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.1 
 
 		 352 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0774  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  27.74 
 
 		 307 aa  108  8.000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0916  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1394  pseudouridine synthase, RluD  28.78 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.377241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14830  Pseudouridine synthase, RluC  29.12 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.300608  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2439  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.96 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7124  pseudouridine synthase, RluA family  26.89 
 
 		 457 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2335  pseudouridine synthase RluD  28.25 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.134936 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3808  RluA family pseudouridine synthase  29.21 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0127606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3403  pseudouridine synthase RluD  29.48 
 
 		 501 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0666836  normal  0.0916306 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1841  pseudouridine synthase, RluA family  25.08 
 
 		 431 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.168334 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2677  pseudouridine synthase, RluA family  27.68 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1322  pseudouridine synthase, RluD  27.14 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000381101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3659  pseudouridine synthase, RluD  27.56 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1019  RluA family pseudouridine synthase  27.37 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.798058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1482  RluA family pseudouridine synthase  28.84 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1517  RluA family pseudouridine synthase  28.39 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000147946  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1041  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C protein  28.52 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.017285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1379  pseudouridine synthase, RluA family  28.28 
 
 		 370 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1286  pseudouridylate synthase  28.32 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00677773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1673  RluA family pseudouridine synthase  26.79 
 
 		 306 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.529944  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2921  pseudouridine synthase, RluA family  28.09 
 
 		 341 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000900564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0857  RluA family pseudouridine synthase  27.24 
 
 		 471 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295039 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  25.61 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1286  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D (pseudouridylate synthase) (Uracil hydrolyase)  26.29 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0257  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.04 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.390571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1563  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  26.13 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.151804 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2844  pseudouridine synthase, RluD  27.18 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0893  pseudouridine synthase, RluA family  29.84 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  25.96 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2729  pseudouridine synthase, RluA family  27.37 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000152231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2303  RluA family pseudouridine synthase  27.65 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>