More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4258 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008539  Arth_4258  ABC transporter related  100 
 
 		 603 aa  1187    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  31.89 
 
 		 586 aa  306  8.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  35.16 
 
 		 592 aa  306  9.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  32.66 
 
 		 625 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  34.43 
 
 		 602 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  30.7 
 
 		 587 aa  303  5.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  34.37 
 
 		 603 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  34.13 
 
 		 607 aa  296  9e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  30.78 
 
 		 591 aa  295  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  34.83 
 
 		 611 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 600 aa  292  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  30.65 
 
 		 588 aa  291  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  30.59 
 
 		 600 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  30.47 
 
 		 603 aa  289  9e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  31.08 
 
 		 594 aa  289  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  33.11 
 
 		 622 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  36.3 
 
 		 600 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  30.34 
 
 		 611 aa  287  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  33.44 
 
 		 621 aa  287  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0817  ABC transporter related  34.54 
 
 		 629 aa  286  8e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  31.87 
 
 		 607 aa  286  8e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  33.78 
 
 		 620 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  33.72 
 
 		 610 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  33.72 
 
 		 610 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  33.68 
 
 		 602 aa  283  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  31.47 
 
 		 597 aa  281  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  31.47 
 
 		 597 aa  281  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  32.76 
 
 		 602 aa  280  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  29.82 
 
 		 611 aa  278  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  29.39 
 
 		 614 aa  278  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  30.45 
 
 		 588 aa  277  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  34.89 
 
 		 610 aa  276  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  29.54 
 
 		 584 aa  276  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  29.83 
 
 		 613 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.62 
 
 		 592 aa  273  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  29.37 
 
 		 608 aa  273  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  34.15 
 
 		 623 aa  273  8.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  30.92 
 
 		 645 aa  273  8.000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  36.36 
 
 		 588 aa  272  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  33.28 
 
 		 610 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  33.28 
 
 		 610 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  33.28 
 
 		 610 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.86 
 
 		 598 aa  272  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  35.36 
 
 		 603 aa  270  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000245046  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  30.65 
 
 		 617 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.29 
 
 		 581 aa  270  8e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.62 
 
 		 632 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  36.27 
 
 		 619 aa  268  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  29.48 
 
 		 590 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  34.45 
 
 		 636 aa  267  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  32.17 
 
 		 600 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  32.07 
 
 		 617 aa  266  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  30.34 
 
 		 610 aa  264  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  30.95 
 
 		 622 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  28.87 
 
 		 619 aa  263  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  28.99 
 
 		 618 aa  263  6.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  29.33 
 
 		 587 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.33 
 
 		 587 aa  262  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  29.33 
 
 		 587 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  29.33 
 
 		 587 aa  262  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.33 
 
 		 587 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.33 
 
 		 587 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  29.15 
 
 		 631 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.33 
 
 		 587 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  31.12 
 
 		 556 aa  262  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  28.67 
 
 		 587 aa  261  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  34.58 
 
 		 594 aa  261  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  31.93 
 
 		 616 aa  260  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  28.65 
 
 		 587 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  31.52 
 
 		 650 aa  260  6e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  28.67 
 
 		 587 aa  259  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3126  ABC transporter related  37.38 
 
 		 592 aa  259  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  29.5 
 
 		 587 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  33.2 
 
 		 606 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  35.46 
 
 		 634 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  36.61 
 
 		 616 aa  257  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  26.7 
 
 		 597 aa  257  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  30.36 
 
 		 635 aa  257  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  30.28 
 
 		 598 aa  257  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  31.72 
 
 		 608 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4342  ABC transporter, transmembrane region  30.71 
 
 		 626 aa  256  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  33 
 
 		 592 aa  256  7e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  31.25 
 
 		 640 aa  256  7e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  29.74 
 
 		 586 aa  256  9e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  29.34 
 
 		 599 aa  255  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  35.34 
 
 		 614 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  31.26 
 
 		 632 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  31.75 
 
 		 619 aa  254  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  31.76 
 
 		 598 aa  254  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  30.37 
 
 		 588 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  33.91 
 
 		 615 aa  253  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  28.23 
 
 		 609 aa  253  7e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  31.98 
 
 		 620 aa  253  7e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  31.68 
 
 		 598 aa  253  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  32.87 
 
 		 619 aa  253  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.98 
 
 		 579 aa  253  9.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  31.28 
 
 		 592 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  30.53 
 
 		 870 aa  253  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08241  putative multidrug efflux ABC transporter  33.02 
 
 		 598 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  31.23 
 
 		 811 aa  252  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>