More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4257 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008539  Arth_4257  ABC transporter related  100 
 
 
613 aa  1196    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  29.93 
 
 
586 aa  252  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  31.65 
 
 
586 aa  250  5e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  31.38 
 
 
587 aa  243  7.999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  29.06 
 
 
606 aa  242  2e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  29.43 
 
 
583 aa  242  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  30.94 
 
 
598 aa  233  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  29.34 
 
 
604 aa  232  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  31.69 
 
 
585 aa  227  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  27.36 
 
 
593 aa  225  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  30.43 
 
 
583 aa  224  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  32.06 
 
 
579 aa  224  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  28.81 
 
 
582 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  27.77 
 
 
575 aa  216  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  29.9 
 
 
600 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  26.5 
 
 
585 aa  215  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.89 
 
 
548 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  30.18 
 
 
569 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  27.39 
 
 
591 aa  208  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  29.52 
 
 
541 aa  208  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  26.79 
 
 
571 aa  206  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.55 
 
 
586 aa  205  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  30 
 
 
611 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.38 
 
 
586 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.38 
 
 
586 aa  204  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  27.38 
 
 
586 aa  203  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  30.08 
 
 
600 aa  203  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  26.19 
 
 
594 aa  203  9e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  27.38 
 
 
586 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.38 
 
 
586 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.38 
 
 
586 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  28.21 
 
 
586 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  26.11 
 
 
589 aa  201  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  26.08 
 
 
588 aa  200  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  27.41 
 
 
573 aa  200  7e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  27.33 
 
 
586 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  26.69 
 
 
583 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  26.73 
 
 
593 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  30.69 
 
 
583 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  30.35 
 
 
575 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  26.72 
 
 
583 aa  198  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  24.58 
 
 
592 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  27.09 
 
 
584 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1391  ABC transporter related  26.96 
 
 
598 aa  197  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.310591  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.66 
 
 
600 aa  196  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  28.26 
 
 
582 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  29.34 
 
 
578 aa  196  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  29.39 
 
 
581 aa  196  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.17 
 
 
589 aa  195  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  27.19 
 
 
579 aa  195  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  25.92 
 
 
573 aa  195  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  27.86 
 
 
596 aa  195  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  28.2 
 
 
811 aa  195  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  27.14 
 
 
583 aa  196  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0038  ABC-type transport system, ATPase and permease components  30.61 
 
 
576 aa  194  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  28.32 
 
 
580 aa  194  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  31.04 
 
 
569 aa  194  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  25.04 
 
 
577 aa  194  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  25.61 
 
 
589 aa  193  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2125  ABC transporter related protein  28.7 
 
 
579 aa  193  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  30.62 
 
 
591 aa  193  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  28.53 
 
 
601 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  27.15 
 
 
601 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  25.88 
 
 
581 aa  192  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  29.95 
 
 
572 aa  192  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3812  ABC transporter related protein  29.39 
 
 
650 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882245  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  31.65 
 
 
1218 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  24.47 
 
 
631 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  29.84 
 
 
755 aa  191  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  27.05 
 
 
582 aa  191  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  29.06 
 
 
649 aa  191  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  31.46 
 
 
613 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  30.3 
 
 
589 aa  190  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  31.39 
 
 
581 aa  190  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  29.5 
 
 
614 aa  190  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  26.75 
 
 
588 aa  190  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1636  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.93 
 
 
586 aa  190  7e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  29.98 
 
 
617 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.4 
 
 
584 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.39 
 
 
609 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  28.55 
 
 
669 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.65 
 
 
1003 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  32.39 
 
 
610 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.71 
 
 
555 aa  189  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  24.19 
 
 
584 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.61 
 
 
605 aa  189  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2849  ABC transporter related  28.66 
 
 
595 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  26.8 
 
 
583 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  26.8 
 
 
583 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  26.83 
 
 
601 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.8 
 
 
583 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  26.2 
 
 
577 aa  189  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.55 
 
 
583 aa  189  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  26.65 
 
 
556 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3385  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  26.8 
 
 
583 aa  188  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  31.47 
 
 
1218 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  29.71 
 
 
586 aa  188  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.72 
 
 
583 aa  187  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  31.47 
 
 
1218 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  27.95 
 
 
609 aa  187  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>