43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4219 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008537  Arth_4500  conjugative transfer gene complex protein  90.51 
 
 		 589 aa  1088    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.610328  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4219  conjugative transfer gene complex protein  100 
 
 		 590 aa  1191    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4560  putative TraG-family protein  90.16 
 
 		 589 aa  1026    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0985941 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4273  conjugative transfer gene complex protein  51.16 
 
 		 591 aa  535  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5521  TRAG family protein  37.77 
 
 		 604 aa  286  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0363  type IV secretory pathway VirD4 component  33.99 
 
 		 602 aa  273  8.000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.397437  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2361  hypothetical protein  37.62 
 
 		 598 aa  261  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.210389  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0263  conjugal transfer protein  31.1 
 
 		 583 aa  216  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0192996  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4938  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  29.29 
 
 		 669 aa  191  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2343  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  30.84 
 
 		 592 aa  156  9e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.970374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1575  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  30.65 
 
 		 592 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.016741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8942  conjugative transfer gene complex protein  28.82 
 
 		 613 aa  147  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312755  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0800  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  32.08 
 
 		 587 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06490  type IV secretory pathway, VirD4 component  27.39 
 
 		 634 aa  137  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00928914  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5436  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  26.13 
 
 		 611 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.561912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06790  hypothetical protein  29.12 
 
 		 594 aa  119  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1438  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  26.81 
 
 		 562 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00273235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4706  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  26.99 
 
 		 490 aa  114  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.220064  normal  0.843758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0452  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  27.73 
 
 		 621 aa  110  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1576  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  25.9 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540203  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0689  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  28.64 
 
 		 636 aa  104  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.01424  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00130  hypothetical protein  29.25 
 
 		 594 aa  103  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2246  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  26.33 
 
 		 506 aa  100  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0604  hypothetical protein  25.65 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  24.54 
 
 		 713 aa  70.5  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3305  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  23.4 
 
 		 690 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000882445  normal  0.114382 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  22.43 
 
 		 670 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  22.2 
 
 		 651 aa  58.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1381  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  24.42 
 
 		 656 aa  54.3  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2738  TRAG family protein  19.89 
 
 		 606 aa  53.9  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0821  TRAG family protein  22.58 
 
 		 673 aa  53.5  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.153462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1514  TRAG family protein  22.16 
 
 		 606 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  20.12 
 
 		 554 aa  50.8  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  20.14 
 
 		 575 aa  50.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  21.05 
 
 		 648 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  20.96 
 
 		 593 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  20.73 
 
 		 576 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  20.74 
 
 		 583 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0788  TRAG family protein  26.95 
 
 		 590 aa  48.1  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0843  TRAG family protein  21.72 
 
 		 682 aa  47  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2951  ATPase involved in conjugal plasmid transfer TRAG  26.49 
 
 		 935 aa  45.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0976  TRAG family protein  30.39 
 
 		 912 aa  44.3  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1362  TRAG family protein  22.34 
 
 		 663 aa  43.5  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>