More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3634 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3634  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  86.57 
 
 		 665 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  84.15 
 
 		 672 aa  470  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  73.67 
 
 		 666 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  73.48 
 
 		 669 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3754  ABC transporter transmembrane region  73.02 
 
 		 613 aa  398  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0785  ABC transporter transmembrane region  71.12 
 
 		 701 aa  391  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00200741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  71.33 
 
 		 652 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  68.9 
 
 		 680 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  71.12 
 
 		 672 aa  387  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  68.46 
 
 		 691 aa  381  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  70.36 
 
 		 670 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  68.77 
 
 		 663 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  77.41 
 
 		 677 aa  376  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0379  ABC transporter related  66.2 
 
 		 653 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  65.14 
 
 		 765 aa  367  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  66.43 
 
 		 649 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  68.12 
 
 		 606 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  65.11 
 
 		 811 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  67.84 
 
 		 661 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  64.91 
 
 		 702 aa  364  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  76.6 
 
 		 691 aa  363  1e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  67.16 
 
 		 634 aa  362  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3822  ABC transporter transmembrane region  65.37 
 
 		 605 aa  360  8e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568746  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  67.15 
 
 		 721 aa  358  5e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  63.96 
 
 		 733 aa  353  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3251  ABC transporter related  70.97 
 
 		 675 aa  352  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  62.95 
 
 		 663 aa  350  1e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  64.38 
 
 		 695 aa  350  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  63.84 
 
 		 631 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11298  drug ABC transporter ATP-binding protein  64.47 
 
 		 631 aa  345  5e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  63.47 
 
 		 631 aa  343  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  63.47 
 
 		 631 aa  343  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  61.37 
 
 		 631 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4441  ABC transporter, transmembrane region  71.37 
 
 		 642 aa  341  7e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  60.73 
 
 		 671 aa  339  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  60.22 
 
 		 598 aa  337  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  59.14 
 
 		 640 aa  323  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0364  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  63.87 
 
 		 593 aa  322  4e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  56.68 
 
 		 613 aa  322  5e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  63.45 
 
 		 593 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.823105  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2077  ABC transporter related  64.63 
 
 		 621 aa  319  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  55.23 
 
 		 628 aa  317  7.999999999999999e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  53.74 
 
 		 637 aa  316  2e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3129  ABC transporter related protein  62.98 
 
 		 591 aa  315  5e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.409554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2433  ABC transporter related  62.34 
 
 		 624 aa  315  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0665672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  57.04 
 
 		 631 aa  315  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  62.13 
 
 		 584 aa  314  7e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  54.06 
 
 		 637 aa  313  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  61.7 
 
 		 628 aa  313  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  63.83 
 
 		 627 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  55.96 
 
 		 625 aa  311  4.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  57.76 
 
 		 618 aa  311  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  62.55 
 
 		 608 aa  311  4.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  53.36 
 
 		 636 aa  311  5.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  57.4 
 
 		 618 aa  310  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  61.02 
 
 		 589 aa  309  2e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  62.71 
 
 		 607 aa  309  2e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1818  ABC transporter related  60.87 
 
 		 601 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000170896 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  58.68 
 
 		 586 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3399  ABC transporter related  59.41 
 
 		 614 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  58.61 
 
 		 595 aa  306  3e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0471  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  59.43 
 
 		 593 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344277  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  57.03 
 
 		 632 aa  300  1e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  54.12 
 
 		 626 aa  298  6e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1712  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  51.96 
 
 		 575 aa  296  2e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  54.77 
 
 		 623 aa  295  5e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  59.27 
 
 		 620 aa  294  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2358  ABC transporter related  58.72 
 
 		 619 aa  293  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  52.54 
 
 		 617 aa  293  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  50.9 
 
 		 615 aa  292  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  58.23 
 
 		 582 aa  292  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0417  ABC transporter related  55.19 
 
 		 597 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  51.97 
 
 		 615 aa  287  1e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0738  ABC transporter related  55.32 
 
 		 614 aa  283  3.0000000000000004e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  58.05 
 
 		 607 aa  282  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  48.56 
 
 		 597 aa  281  6.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  58.97 
 
 		 582 aa  281  6.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  48.56 
 
 		 597 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  52.75 
 
 		 646 aa  280  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  54.2 
 
 		 619 aa  280  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  57.79 
 
 		 608 aa  279  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1070  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  56.33 
 
 		 577 aa  278  4e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00802304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  56.56 
 
 		 614 aa  277  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1682  ABC transporter related  55.46 
 
 		 613 aa  276  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  49.46 
 
 		 620 aa  275  4e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  54.04 
 
 		 607 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  54.04 
 
 		 609 aa  270  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  54.22 
 
 		 598 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  48.74 
 
 		 598 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1500  ABC transporter related protein  53.62 
 
 		 630 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000079767  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1948  multidrug ABC transporter ATPase/permease  54.11 
 
 		 671 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.720417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.38 
 
 		 598 aa  267  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  48.38 
 
 		 598 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  56.67 
 
 		 625 aa  265  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1257  hypothetical protein  53.22 
 
 		 639 aa  265  5e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0359  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  52.97 
 
 		 635 aa  264  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.101068  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0885  ABC transporter related  53.16 
 
 		 638 aa  264  1e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0703423 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1386  ABC transporter related  51.05 
 
 		 629 aa  264  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000285289  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  48.01 
 
 		 598 aa  263  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>