21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2333 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2333  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  259  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607058  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2852  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.68 
 
 
126 aa  167  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2282  hypothetical protein  54.03 
 
 
132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3019  hypothetical protein  56.56 
 
 
124 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3702  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.67 
 
 
120 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3430  hypothetical protein  52.68 
 
 
122 aa  136  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2641  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.74 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.17261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6212  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.97 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0947476  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1637  cupin 2 domain-containing protein  41.18 
 
 
137 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.316087  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1363  cupin 2 domain-containing protein  44.55 
 
 
118 aa  101  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0500  hypothetical protein  37.5 
 
 
126 aa  100  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1290  hypothetical protein  37.82 
 
 
119 aa  100  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00531364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0528  hypothetical protein  40.52 
 
 
124 aa  97.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0331265  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3001  hypothetical protein  35.96 
 
 
122 aa  94.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00623326  decreased coverage  0.0000358597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1574  hypothetical protein  40 
 
 
120 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2431  hypothetical protein  38.3 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0800028  normal  0.133087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2480  hypothetical protein  41.05 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.289333 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18632  predicted protein  38.96 
 
 
267 aa  62.8  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  unclonable  0.000481195 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.83 
 
 
113 aa  43.5  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0207  hypothetical protein  38 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.46 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>