More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1344 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1344  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000182733  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  52.07 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  51.48 
 
 		 195 aa  182  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  51.48 
 
 		 195 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  51.48 
 
 		 195 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  51.48 
 
 		 195 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  51.48 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  49.45 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  52.02 
 
 		 202 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  52.12 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  52.12 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 166 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 166 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  48.11 
 
 		 219 aa  177  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  51.52 
 
 		 166 aa  177  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  48.89 
 
 		 238 aa  177  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  53.94 
 
 		 172 aa  174  7e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  51.83 
 
 		 252 aa  174  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  48.35 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  49.42 
 
 		 190 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  49.69 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  47.67 
 
 		 175 aa  165  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  47.59 
 
 		 174 aa  164  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 		 164 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  45.76 
 
 		 187 aa  164  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 		 190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  49.4 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  49.4 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  44.81 
 
 		 225 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 		 194 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  44.39 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  45.78 
 
 		 170 aa  159  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  45.3 
 
 		 277 aa  158  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  46.55 
 
 		 351 aa  158  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  43.86 
 
 		 239 aa  157  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  47.83 
 
 		 164 aa  157  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 202 aa  157  9e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  44.71 
 
 		 212 aa  156  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  46.99 
 
 		 401 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  47.09 
 
 		 415 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  46.3 
 
 		 173 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  43.68 
 
 		 249 aa  155  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  46.06 
 
 		 173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  44.71 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  47.1 
 
 		 181 aa  154  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0447  translation initiation factor IF-3  52.83 
 
 		 164 aa  154  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472838  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  45.78 
 
 		 396 aa  154  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  43.83 
 
 		 173 aa  154  9e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  50.3 
 
 		 171 aa  154  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  45.93 
 
 		 233 aa  153  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  45.78 
 
 		 356 aa  153  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  44.85 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  47.83 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  46.5 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 182 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  45.56 
 
 		 178 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  45.35 
 
 		 329 aa  152  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 204 aa  151  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  42.05 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  44.51 
 
 		 186 aa  151  5e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 177 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1738  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 200 aa  150  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1772  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 200 aa  150  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000139127  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  44.24 
 
 		 182 aa  150  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  46.06 
 
 		 172 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1244  translation initiation factor IF-3  52.41 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000317297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  48.99 
 
 		 154 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  45.56 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  44.74 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  43.21 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  42.77 
 
 		 243 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  43.27 
 
 		 222 aa  148  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  43.27 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  43.27 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  43.64 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  43.27 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 184 aa  148  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 177 aa  147  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 		 205 aa  147  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  42.69 
 
 		 204 aa  147  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  42.86 
 
 		 179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  43.03 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 		 169 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  43.83 
 
 		 171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 177 aa  146  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2146  translation initiation factor IF-3  50.91 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000692224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  43.21 
 
 		 178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  46.79 
 
 		 173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  41.88 
 
 		 173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  43.21 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  42.42 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 		 173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>